甲状腺癌是最常见的内分泌器官的恶性肿瘤,在全身肿瘤中,其发病率大约占到1%,其在男性女性之间的发病率有着巨大差异,女性发病率约为是男性的3-4倍。从分子水平去寻找男性和女性之间甲状腺癌差异表达基因,探究生物学过程意义,对于了解甲状腺癌的发病机制以及性别差异的原因,以及对未来甲状腺癌的预防和诊断治疗都有着积极的意义。本研究利用Ucsc＿xena平台下载的TCGA数据库的甲状腺癌（THCA）的RNA-seq基因表达数据和临床表现型数据,获取到572个甲状腺癌患者样本的20530个基因数据和580个样本的临床数据,对数据进行匹配并剔除癌症转移类型样本后,得到136个男性癌症组织样本,17个癌旁组织样本,369个女性癌症组织样本,42个女性癌旁组织样本。利用R语言编程处理数据,并利用生物信息学包limma包、edge R包和DESeq2包对RNA-Seq数据进行差异表达基因的筛选。首先将癌症基因组织数据按照男性和女性进行差异表达分析,得到性别差异表达的甲状腺癌基因,其次在男性中甲状腺癌组织基因和癌旁组织基因数据进行差异分析,得到男性甲状腺癌差异表达基因,女性样本数据作同样处理得到女性甲状腺癌差异表达基因。接下来利用男性差异表达基因和女性差异表达基因的差集和性别差异表达基因的交集作为男性特异性甲状腺癌差异表达基因,同样的用女性差异表达基因与男性差异表达基因的差集与性别差异基因的交集,作为女性特异性甲状腺癌差异表达基因。最后对三种方法得到的男性和女性特异性表达基因取交集作为男性和女性特异性差异表达基因,其中男性特异性差异表达基因ALG10、DNASE2B和TMEM181,女性特异性差异表达基因AGAP11、AK5、ALG13、CASQ2、DZIP1L、IL13RA2、KCTD21、NR2E3、PLCXD1、PRKY、ZNF182等19个,并对这些基因进行生物学注释。为进一步探究我们筛选到的性别差异表达的甲状腺癌相关基因,我们对男性和女性差异基因进行WGCNA分析,通过寻找这些差异基因所属的模块来探索其与甲状腺癌之间的关系。通过构建共表达网络,在男性差异表达基因中我们得到16个基因模块,其中有两个模块中包含男性特异性差异表达基因（turquoise模块和yellow模块）。女性差异表达基因中得到19个基因模块,其中九个模块包含女性特异性表达基因,三个模块（turquoise模块、purple模块和blue模块）中包含三个及以上女性特异性差异表达基因,并且其中purple模块中的一个hub基因就是我们所筛选的到的女性特异性差异表达基因（ZNF182基因）,进一步证实该基因可能是女性特异性甲状腺癌的差异表达基因。我们对两个男性基因模块和三个女性基因模块进行KEGG通路分析,寻找这些模块可能与导致甲状腺癌发生的某些信号通路相关。我们发现男性turquoise模块与Wnt信号通路有关,女性turquoise模块与PI3K/AkT信号通路有关,女性purple模块与p53信号通路有关,女性blue模块与MAPK信号通路有关,这四个信号通路是被证实的与甲状腺癌发生相关的信号通路。