思想政治教育是高校综合素质教育的核心，高职院校的思想政治理论课（以后文中简称为“思政课”）是对大学生进行思想政治教育的主渠道。然而目前高职院校思政课还是存在着脱离学生实际，空调说教、枯燥乏味的现象，本文针对高职院校不同专业学生的思政课教学改革进行了较为深入的探析。首先简述相关概念及针对不同专业学生因材施教的一般理论。其次，通过问卷调查、访谈等方法，从不同专业学生的差异性的角度分析高职院校思政课教学的现状，探求学生在思政课认识的差异性、教学内容的差异性以及教学过程的差异性与不同专业学生的思政课因材施教之间关系；通过深入分析高职院校思政课教学中忽视学生专业差异性，发现学生学习思政课的兴趣、课堂教学效果、人才培养目标实现等方面存在的问题。最后，根据高校不同专业公共课因材施教的一般经验，针对不同专业学生对高职院校思政课的课程体系、教学过程和教学师资等进行比较和分析，提出了三个方面的改革建议：（1）课程体系方面，注重课程建设的针对性有效性，突出理论教学内容的专业背景，强化实践教学内容与专业实习的对接；（2）教学过程方面，通过了解不同专业的学生，设计可行的教学方案，选择合适的教学方法，做好评价工作等途径提高思政课的教学效果；（3）师资建设方面，制定师培计划，调整教师的知识结构，加强与专业知识的整合，关注教师政治、经济地位和职业认同感，从而建设一支稳定的“专家型”思政课教师队伍。案例分析是本文的一大特色。本文作者结合自己的实际工作，对**职业技术学院进行问卷、座谈和访谈等调查，为论文的基本观点提供了实证材料。