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小麦族(Triticeae Damort.)是禾本科(Poaceae)的一个重要的类群。它不仅包括小麦、大麦和黑麦等重要的麦类作物，而且还含有很多价值很高的优质牧草物种。拟鹅观草属(Pseudoroegneria(Nevski) A, L6ve)和赖草属(Leymus Hochest.)是小麦族重要的多年生属，有些物种为优异的牧草种类，拥有抗病、虫、耐环境胁迫、高产等特点，是麦类作物和牧草遗传改良的重要种质资源。拟鹅观草属的St基本基因组是小麦族150个以上物种St基因组的供体。赖草属Ns基因组来自新麦草属，Xm基因组的来源一直存在争议。这些基因组的研究将促进小麦族系统发育关系的理解，为该类植物的合理利用铺垫基础。
本论文开发了赖草属和拟鹅观草属植物的叶绿体基因组和核基因组SSR分子标记，并根据这些分子数据分别分析了它们的系统发育关系。主要结果如下：
1.19对叶绿体SSR引物在拟鹅观草属和赖草属中均有15对具清晰可重复的扩增结果，可转移率为78.9％，多态性引物分别有13对和10对。93对基因组SSR引物在拟鹅观草属和赖草属中均有20对具有扩增结果，可转移率仅为21.5％，多态性引物均有17对。
2．拟鹅观草属植物的叶绿体SSR的遗传分化系数较高(Gst=0.7114)，种间分化明显。基因流值较低(Nm=0.2029)，种间基因交流较少。拟鹅观草属叶绿体SSR的系统发育树，由三个分支（Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ）构成。分支Ⅰ为分布于俄罗斯的物种；此外，还包括来自中国新疆的四倍体拟鹅观草属植物，说明这些四倍体植物的母本供体可能来自俄罗斯。分支Ⅱ为分布于伊朗的拟鹅观草属植物；分支Ⅲ为分布于中国新疆和美国的拟鹅观草属植物。拟鹅观草属核基因SSR的系统发育树，有明显地理分布格局的三个的分支（Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ）构成。拟鹅观草属的叶绿体和核SSR的系统树说明该属植物的亲缘关系有明显的地理分别格局。但美国拟鹅观草属植物处于叶绿体和核的SSR系统树上的不同分支上，它们与其他拟鹅观草属植物的关系尚需进一步的研究。
3．赖草属的叶绿体SSR的遗传分化系数较高(Gst=0.8730)，种间分化明显。基因流水平低(Nm=0.0728)，种间的基因交流较少。赖草属的叶绿体SSR的系统发育树说明其种间关系分化明显，同一个物种的不同个体聚在一起，由两个分支（Ⅰ和Ⅱ）构成。分支Ⅰ为分布于欧亚的物种。分支Ⅱ为分布于美国的拟物种。在叶绿体SSR的系统发育树上，八倍体植物L.angustus与四倍体植物L.chinensis、L.pseudoracemosus、和L.karelinii聚在一起、八倍体植物L.racemosus与四倍体植物L.racemosus subsp.sabulosus和L.ramosus聚在一起以及八倍体植物L. ambiguuus与四倍体植物L. condensatus聚在一起，这说明这些八倍体植物与这些四倍体植物的母本来源相似或者这些八倍体植物起源于这些四倍体植物的自身多倍化。赖草属核SSR的系统发育树进一步说明其种间明显分化的亲缘关系。