【摘 要】
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背景:炎症性肠病的确切病因尚未阐明。近年来,炎症性肠病患者肠道菌群的研究受到高度关注。但炎症性肠病患者肠道菌群的研究结果并不一致,且以往对炎症性肠病的菌群组成研究较多,对菌群的功能研究较少。目的:本研究通过分析炎症性肠病患者粪便微生物群的组成,并进行菌群功能预测分析,探索肠道菌群影响炎症性肠病的机制。方法:从广西医科大学第一附属医院招募符合标准的炎症性肠病患者及年龄、性别匹配的健康对照人群,并采集
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背景:炎症性肠病的确切病因尚未阐明。近年来,炎症性肠病患者肠道菌群的研究受到高度关注。但炎症性肠病患者肠道菌群的研究结果并不一致,且以往对炎症性肠病的菌群组成研究较多,对菌群的功能研究较少。目的:本研究通过分析炎症性肠病患者粪便微生物群的组成,并进行菌群功能预测分析,探索肠道菌群影响炎症性肠病的机制。方法:从广西医科大学第一附属医院招募符合标准的炎症性肠病患者及年龄、性别匹配的健康对照人群,并采集研究对象的新鲜粪便样本。采用E.Z.N.A.（?）soil试剂盒提取粪便样本的总DNA。使用PCR技术扩增样本细菌的16s rRNA基因V3-V4高变区,然后应用Miseq PE300平台对回收、纯化后的PCR扩增产物进行测序,并在I-Sanger生物云平台上进行菌群组成分析及16s功能预测分析。比较炎症性肠病组与健康对照组,炎症性肠病组不同分型（包括溃疡性结肠炎和克罗恩病）与健康对照组,以及炎症性肠病组不同分型间的菌群组成及功能差异。结果:（1）本研究的粪便样本来源于20例克罗恩病患者,10例溃疡性结肠炎患者和30例健康对照人群;（2）16s rRNA测序结果显示炎症性肠病组与健康对照组粪便菌群α多样性无显著差异（P>0.05）,健康对照组α多样性丰度显著高于克罗恩病组（P=0.027）;（3）主坐标分析显示炎症性肠病组与健康对照组β多样性差异有显著性（P<0.01）,且炎症性肠病组不同分型间β多样性差异也有统计学意义;（4）与健康对照组比,炎症性肠病组菌群结构存在紊乱。在门水平,炎症性肠病组变形菌门丰度显著富集（P=0.001）,健康对照组Epsilonbacteraeota显著富集（P=0.004）,此外溃疡性结肠炎组酸杆菌门丰度显著高于健康对照组（P=0.010）和克罗恩病组（P=0.044）;（5）在纲水平上,炎症性肠病组γ-变形菌纲丰度显著高于健康对照组（P<0.001）,溃疡性结肠炎组弯曲杆菌丰度显著高于健康对照组（P=0.024）;（6）在目水平上炎症性肠病组β变形菌目（P=0.001）、肠杆菌目显著升高（P=0.022）,克罗恩病组Sneathiellales丰度显著高于健康对照组（P=0.017）,溃疡性结肠炎组柄杆菌目丰度显著高于健康对照组（P=0.012）和克罗恩病组（P=0.026）;（7）在科水平上,与健康对照组比,克罗恩病组拟杆菌科（P=0.025）、伯克氏菌科（P=0.001）丰度显著升高,溃疡性结肠炎组肠杆菌科丰度显著升高（P=0.031）;（8）在属水平上,与炎症性肠病组比,健康对照组巨单胞菌属（P=0.004）、毛螺菌属（P<0.001）、瘤胃球菌属（P=0.018）丰度显著升高,埃希氏菌-志贺菌属丰度显著降低（P=0.006）。克罗恩病组巨球菌属（P=0.044）、劳尔氏菌属（P=0.049）、拟杆菌属（P=0.025）丰度显著高于健康对照组;溃疡性结肠炎组肠球菌属丰度显著高于健康对照组（P=0.031）;（9）健康对照组菌群遗传信息处理、免疫系统通路显著富集,而炎症性肠病组缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸生物合成通路和初级胆汁酸生物合成通路显著富集（P<0.05）。克罗恩病组初级胆汁酸生物合成、次级胆汁酸生物合成通路水平显著高于健康对照组;此外克罗恩病组鞘磷脂代谢通路水平显著高于健康对照组及溃疡性结肠炎组（P<0.05）。结论:与健康对照组比,炎症性肠病患者肠道菌群中存在致病菌增多及潜在有益菌减少,同时,疾病组氨基酸生物合成、鞘脂类代谢、初级胆汁酸和次级胆汁酸生物合成通路发生改变。
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