基于血清蛋白质组学的放射性肺炎生物标记物

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yubil
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的放射性肺炎(Radiation Pneumonitis,RP)是非小细胞肺癌放疗的常见并发症,也是肿瘤放疗提高剂量的主要限制因素。因此需要可靠的生物标志物来更准确的预测放射性肺炎,以制定个体化的治疗方案,降低放射性肺炎的发生。本实验采用非小细胞肺癌患者血清样本为研究对象,通过全蛋白组学定量分析筛选放疗后发生肺炎组和未发生肺炎组患者在不同时间点(0,3,6周)血清蛋白组表达的差异蛋白,进一步分析筛选相关生物标志物,为临床非小细胞肺癌放疗发生放射性肺炎提供预测因子。方法2017年10月至2018年7月28例我院经病理证实的局部晚期非小细胞肺癌初治患者,所有患者均接受调强放疗,放疗剂量50-66Gy,中位剂量60Gy。分别于放疗前、放疗第3周、放疗第6周留取血清标本。放射治疗结束后,所有患者均至少随访半年。这28例患者共有3例发生≥2级放射性肺炎(评价标准依照RTOG急性放射性肺炎分级标准)。这3例患者的血清为实验组(RP组),再从其它25例中分别选取与实验组具有相同性别、相同病理类型、相近年龄及临床分期的患者血清为对照组(C组),形成纵向3×3配对。采用TMT标记定量及液相色谱-质谱联用分析技术鉴定差异表达蛋白质,并通过相关生物信息学分析方法进行分析,包括差异表达蛋白的功能注释、功能富集分析和蛋白互作网络分析。结果通过对肽段的质谱分析,共有812个可定量蛋白,生物信息学分析进一步揭示,这些蛋白主要参与结合、生物调控过程、代谢过程、信号传导过程以及在KEGG中参与百日咳信号通路。以1.2倍为差异表达变化阈值及统计学检验t-test p<0.05为显著性阈值,我们发现ZYX和FETUB在放疗前组和放疗第3周组都发生表达上调,它们在放射性肺炎组和未发生肺炎组表达的比值分别为1.40和1.687(放疗前组)、1.62和1.701(放疗第3周组);CSTA和CALML5在放疗前组和放疗第6周组都发生表达下调,比值分别为0.67和0.584(放疗前组)、0.644和0.528(放疗第6周组);而NNT在放疗前组、放疗第3周组和放疗第6周组中全都发生显著下调表达,比值分别为0.296、0.314、0.238。放疗前组中的NNT、HPR和PZP发生显著下调(同时也是三组所有差异蛋白中下调最显著的),它们的比值分别为0.296、0.377、0.376。通过STRING数据库检索蛋白互作网络图发现这些差异蛋白中FETUB与PZP存在相互作用,而PZP与已报道的放射性肺炎病理生理通路,如TGF-β、IL-1β、IL-6、TNF及炎性反应相关通路之间有一定的相关性。结论通过蛋白质组学方法发现非小细胞肺癌患者放疗前、中、后外周血在发生和未发生放射性肺炎中存在差异表达蛋白,部分在放疗期间无变化,部分有一定的变化。基于蛋白组学分析方法及蛋白互作网络图,我们发现FETUB与PZP是与放射性肺炎相关的最佳的候选蛋白,可做为下一步验证预测放射性肺炎的生物标记物提供基础。
其他文献
目的:探讨分析影响动脉瘤性蛛网膜下腔出血(aSAH)术后分流依赖性脑积水(SDHC)发生相关因素,并研究术后腰穿对SDHC发生率的影响。以便在围手术期进行控制,积极预防SDHC的发生,减少患者神经系统功能损害。方法:对2009-2019年期间在我院神经外科接受开颅动脉瘤夹闭术的aSAH患者进行了回顾性分析。纳入标准:1.术前经头颅CT、CT血管造影(CTA)或全脑数字减影血管造影(DSA)确诊的a
目的:通过对术前膜性尿道长度联合前列腺体积进行分析,从而建立一种能够预测腔镜下根治性前列腺切除术后尿控的分析模型。方法与材料:收集2014年1月至2019年1月期间由福建医科大学附属第一医院泌尿外科同一位从事该专业15年以上的经验丰富的主任医师主刀完成的腹腔镜下根治性前列腺切除术患者的临床资料,排除腹腔镜手术中转开放、既往接受过前列腺手术、放射治疗、内分泌治疗、临床资料不完全、前列腺MRI图像信息
目的:颅内出血(intracranial hemorrhage,ICH)是新生儿的常见疾病,颅内出血属于产科、新生儿科共同面对的严重疾病,胎龄或出生体重越低,ICH发生率越高,且越严重,对于严重颅内出血的早产儿,死亡率高达27%~50%[1,2],幸存者亦常留有不同程度的神经系统后遗症,如癫痫、脑瘫、感觉运动障碍以及认知、行为障碍等,这些无疑给患儿家庭及社会经济带来严重的负担。本研究分析新生儿颅内
目的:分析45例原发性甲状旁腺功能亢进症(PHPT)患者的临床特征,并探讨PHPT与高血压的相关关系及手术治疗对血压的影响。方法:回顾性分析了2012年8月至2019年10月就诊厦门大学附属中山医院的45例通过手术治疗最终病理确诊为PHPT患者的临床和实验室检查特点,包括一般资料、生化指标、血压、临床表现、术后病理。根据临床表现将45例PHPT患者分为有症状组和无症状组,对两组各指标差异进行对比分
【目的】本研究旨在探讨NLR(neutrophil to lymphocyte ratio,中性粒细胞与淋巴细胞比值)与ICIs(immune check point inhibitors,免疫检查点抑制剂)疗效的相关性,对ICIs治疗后发生HPD(hyperprogressive disease,超进展)的临床特性及其生存期进行分析,以探讨其可能的预测标志物。【方法】通过系统检索Pub Med、
目的分析妊娠期单纯低甲状腺素血症(Isolated maternal hypothyroxinemia,IMH)与各种妊娠不良结局的关系。方法采用回顾性分析,选取2017年1月1日至2018年1月31日之间在福建医科大学附属第二医院妇产科住院分娩产妇313例,根据FT4检验值分为2组:A组(正常组):FT3、FT4、TSH值在正常范围,共151例。B组(IMH组):TSH及FT3值在正常范围,FT
目的:观察单纯内镜下肠道支架置入术在结直肠癌性梗阻患者中的疗效。方法:回顾性收集2017年01月至2019年02月间福建医科大学附属协和医院收治的结直肠癌性梗阻患者133例,其中48例(36.1%)行姑息性单纯内镜引导下支架置入术,另85例(63.9%)先行单纯内镜下置入术改善梗阻症状,再过渡行手术治疗。收集患者临床资料,分析姑息治疗组及过渡外科手术组肠道支架置入的成功率、梗阻解除率、胃肠道恢复时
第一部分MRI 3D SPACE T2WI序列检查对垂体腺瘤侵犯海绵窦的诊断价值研究目的回顾性分析不同序列垂体MRI上海绵窦内侧壁的成像特点,评估SPACE序列上海绵窦内侧完整性对垂体腺瘤侵犯海绵窦的诊断价值。方法收集2018年11月至2019年12月在我院医学影像中心连续行垂体MRI检查的病例。纳入标准:①病历资料完整;②在我院3.0T磁共振扫描仪行垂体MRI检查者;排除既往有鞍区手术、放疗、药
目的:本研究旨在探究复发或转移性鼻咽癌患者PD-1单抗耐药后联合姑息放疗的疗效,观察联合姑息放疗下能否逆转机体对PD-1单抗的耐药以及是否发生“远隔效应”现象。材料和方法:本研究回顾性分析了我院12例PD-1单抗治疗后,且经RECISTv1.1评估为疾病进展的复发或转移性鼻咽癌患者,针对复发灶或转移灶给予总剂量为18Gy-36Gy、单次分割剂量3Gy-6Gy的局部姑息放疗,同时继续接受PD-1单抗