【摘 要】
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油菜作为重要的油料作物,随着全球气候变化,常年受到干旱的影响,严重制约其发展.本研究在前期油菜抗旱生物学研究的基础上,以筛选出的耐旱和旱敏感品种(系)为材料,运用高
【机 构】
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河南大学生命科学学院,棉花生物学国家重点实验室,河南开封,475004
【出 处】
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中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会
论文部分内容阅读
油菜作为重要的油料作物,随着全球气候变化,常年受到干旱的影响,严重制约其发展.本研究在前期油菜抗旱生物学研究的基础上,以筛选出的耐旱和旱敏感品种(系)为材料,运用高通量的转录组测序(RNA-seq)技术对干旱诱导和非诱导胁迫处理的转录组进行深度测序,使用短序列组装软件SOAPdenovo对4个转录组测序结果进行从头组装(De novo),建立油菜抗旱转录组数据库,并与蛋白数据库nr、Swiss-Prot、KEGG和COG进行序列比对、功能注释及代谢通路分析；在此基础上,进行油菜抗旱差异表达基因分析,筛选与油菜抗旱相关的基因,对其抗旱机制进行探究.本研究在4个样本中共得到2.7亿条90 bp的高质量配对短序列(clean reads).采用短序列组装软件SOAPdenovo进行序列组装,共获得107,294条Unigenes,有85,026个Unigenes(占所有Unigenes的79.25％)可以直接确定其CDS区及序列方向.通过对不同抗旱性油菜干旱胁迫处理前后转录组差异表达基因分析,干旱胁迫处理前后在耐旱品种中筛选到差异表达基因5060条,在干旱敏感品种中筛选到差异表达基因2608条(|log2 Ratio|≥1且FDR≤0.001).
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