序列拼接相关论文
使用全基因组鸟枪测序法对微生物种群进行测序,常用动态规划方法寻找两两序列片断之间的重叠区域,根据重叠信息拼接出全序列.由于......
生物序列的拼接是生物信息学中常见的问题,其中phrap算法是目前最流行的拼接算法之一.然而phrap算法在处理大规模数据时的运算速度......
在现实生活中，对大型物体进行全景拍摄时，一种方法是增加拍摄物距，但获得的全景图细节信息不够丰富，并且实际拍摄场地可能会限制拍摄。......
生物信息学是一门综合利用生物学、计算机科学、数学等学科知识的新兴交叉学科，其主要任务是揭示海量生物学数据中蕴含的生物学意义......
对蛋白质全序列进行测定,有助于分析蛋白质的结构,揭示蛋白质的生物学功能.针对目前基于质谱的蛋白质测序流程中使用特异性蛋白酶......
随着高通量测序技术的快速发展,出现了很多应用高通量测序数据的结构变异检测方法。由于高通量测序本身的局限性,例如片段较短、测......
没有人否认,分布式集群技术让高性能计算在不断突破峰值纪录的同时,迅速走向普通大众,上世纪80-90年代还是巴统组织的禁运技术,现......
依托复旦大学生命科学院的上海博容基因开发有限公司新近建成了我国第一个人类基因数据库。《科技日报》称,该数据库可直接从基因......
【目的】建立快速获取55型腺病毒的全长基因组序列的方法。【方法】根据55型腺病毒的基因组特点,设计覆盖55型腺病毒基因组序列的1......
【目的】蜡蚧轮枝菌是一种防治植物病原物和害虫的生防菌,弄清其致病的分子基础具有重要的意义。【方法】利用Illumina HiS eq技术......
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黄嘴白鹭(Egretta eulophotes)是全球濒危的鸟类之一。本文设计了一系列引物用于PCR扩增黄嘴白鹭的线粒体全序列。PCR扩增产物的片......
水稻OsBADH2基因功能丧失是稻米产生香味的内因.本研究对7份贵州禾和2份对照品种的香味性状进行物化鉴定,发现榕禾与2个对照品种为......
GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶催化GDP-D-甘露糖的合成,是植物抗坏血酸生物合成途径中上游的关键酶。以马铃薯GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶cDN......
序列拼接是全基因组测序的核心问题之一.基于"overlap-layout-consensus"的传统拼接软件虽然被人们应用于人类基因组拼接等项目,但......
从NCBI(National Center for Biotechnology Information)数据库下载7 259条菊花相关表达序列标签(EST)序列,经去除冗余序列拼接后......
随着微生物全基因组序列测定速率的加快,有必要开发和集成基于PC／Linux系统并以免费数据库管理系统、免费软件和公共数据库资源为主......
目的克隆地黄中介体亚基基因Rg Med6,分析其编码的蛋白序列特征和基因表达特性。方法利用地黄转录组数据库进行同源比对,获得拟南......
该文从挂篮荷载计算、施工流程、支座及临时固结施工、挂篮安装及试验、合拢段施工、模板制作安装、钢筋安装、混凝土的浇筑及养生......
本研究利用Genefishing技术经差异表达技术从花生冷胁迫中分离生长素抑制蛋白基因,经荧光定量PCR验证,随着种子冷胁迫处理时间的延......
为了解柑橘优良砧木枳(Poncirus trifoliata)根部的基因表达信息,利用SMART技术构建了枳的根组织全长c DNA文库。检测结果显示所建......
基因组序列拼接的主流方法是将整条序列随机打断成小片段,然后根据片段间重叠关系连接成长序列.由于较多噪音存在,算法复杂度高,加......
用设计的引物对胸膜肺炎放线杆菌1、3、6、9型标准株的荚膜多糖输出部分基因序列进行了扩增、克隆、测序,分别获得4个型的部分cpxD......
提出一种基于OGSA的生物计算网格体系结构,分析研究了生物应用标准化、资源描述、作业描述和作业调度等,对序列拼接应用Phrap在该......
针对目前基于测序的结构变异检测方法检测效果较差的问题,提出了基于序列拼接的长插入变异（ISALins）检测方法。首先融合3种不同检测......
本文阐述了如何在Intranet环境中设计并实现一个通用的基因测序电子克隆系统，以满足各研究院所的大规模、快速数据分析工作需要。......
在国际最大公共数据库GenBank的dbEST数据库中收录了大量各种生物的ESTs，这些大量的EST序列对发现、克隆和定位新基因，构建遗传图谱，......
目的设计一种基于高通量测序数据的功能强大、处理速度快且不依赖于运行环境的本地化的微生物检测算法。方法对微生物基因组进行分......
基因组序列拼接的主流方法是将整条序列随机打断成小片段,然后根据片段间重叠关系连接成长序列.由于较多噪音存在,算法复杂度高,加......
近几年飞速发展的高通量测序技术（next generation sequencing,NGS）在生命科学研究的各个领域充分展现了其低成本、高通量和应用面广......
有许多软件可以帮助分子生物学工作者解决一些他们日常实验室工作中遇到的问题.Vector NTI Suite是一种高度集成、功能齐全的分子......
提出了一种新的测序纠错算法．该算法在对测序数据拼接之前对其进行检查，找出并修正测序序列中的错误，该算法将测序数据映射成欧拉超路......
用设计的引物对胸膜肺炎放线杆菌1、3、6、9型标准株的荚膜多糖输出部分基因序列进行了扩增，克隆，测序，分别获得4个型的部分cpxDC基因......
“00后”的手游天下： 下课后想要轻松娱乐，可是又没有机会打开网游副本，如何一展我得心应手的游戏技能呢？不用多说，当然是风靡的手游......
某控制软件有加载模式和应用模式.控制终端输入命令进入加载模式选择当前软件运行在哪一个模式下.加载程序负责当前板子里运行的是......
由我国科学家发起和主导的国际黄瓜基因组计划研究取得重大突破，通过采用新一代测序技术，自主开发了一套全新序列拼接软件．成功的以较......
提出了一种基于图划分的全基因组并行拼接算法．该算法巧妙地将数据划分问题转化成图划分的问题，解决了传统数据划分算法中存在的节点......
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在已有测序数据基础上,利用三种常见的序列组装软件对Paenibacillus Shenyangensis全基因组测序结果进行拼接组装,分析比较了不同......
本论文共包括两部分工作,一部分是对枯草芽胞杆菌(Bacillus subtilis)BSn5中新型抑菌蛋白APn5进行了鉴定及性质研究;另一部分是利......
为了充分挖掘现有的庞大EST数据资源所蕴含的生物学信息,系统的分析方法 对其研究显得尤为重要.该文参照目前广泛运用的3种EST数据......
新一代大规模平行测序技术能以相当低的单位成本下提高测序通量,但是大量DNA小片段的拼接组装极具挑战性,如果序列拼接这个关键步......
针对DNA序列拼接中的重复序列识别及屏蔽问题,通过对前期定长子串方法的改进,提出了一种基于变长子串的新算法。新算法在扫描shotg......
目的利用生物信息学和实验相结合的方法,补平已知拼接序列中的缺失片段,获得日本血吸虫乙醛脱氢酶全长基因编码序列。方法通过生物......
