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表型组学是近年来发展起来的一门新科学,主要对在不同环境下的基因型全部细胞表型进行系统研究。表型组学在基因型-表型作图、复杂性状疾病的遗传基础研究、作物改良方面都有广泛的应用,同时表型组学研究也面临着巨大挑战。基因组数据的广泛特征直接催生了以基因组序列为研究起点的新科学。就表型组学的学科范畴进行深入浅出的介绍,综述表型组学在基因型-表型作图、复杂性状疾病的遗传基础研究、作物改良方面的应用以及表型组学研究面临的挑战。并就目前生物信息学在表型组学中的应用以及表型组学未来和展望进行讨论。