铜死亡相关基因在肝细胞癌中的表达及其临床意义

来源 :中国普通外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:youlan26
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背景与目的:肝细胞癌(HCC)是一种全球常见的恶性肿瘤,具有高复发率和高病死率。铜死亡是一种新型的程序性细胞死亡,涉及肿瘤细胞的增殖和生长、血管生成和转移。因此,本研究探讨铜死亡相关基因(CRGs)在HCC中的表达与预后的关系,并建立预后相关的列线图模型以及分析CRGs与HCC免疫细胞浸润的关系。方法:使用R语言“limma”包对TCGA数据库下载的HCC组织与正常组织的数据中CRGs进行差异表达分析;“clusterProfiler”包进行GO和KEGG分析;单因素Cox回归分析筛选与预后相关的CRGs,LassoCox回归分析构建HCC中CRGs相关预后评分模型;“ggsurvplot”包以总生存(OS)为结局绘制Kaplan-Meier生存曲线;“survival ROC”包绘制ROC曲线评估预后评分的准确性;“regplot”和“rms”包绘制列线图和校准曲线;利用TIMER数据库分析CRGs的表达与6种免疫细胞丰度之间的关系。结果:与正常组织相比,HCC组织19个CRGs中的16个有差异表达(上调:PDHB、PDHA1、MTF1、LIPT1、LIPT2、LIAS、GLS、DLD、DLST、DLAT、CDKN2A、ATP7A;下调:SLC31A1、GCSH、DBT、NLRP3);NLRP2的突变频率最高(12%)。GO和KEGG分析表明,CRGs富集于三羧酸循环、碳代谢作用、丙酮酸代谢、糖酵解/糖异生和铂类药物耐药性等信号通路。基于单因素Cox回归分析和Lasso-Cox回归分析筛选出影响HCC预后OS的3个CRGs (CDKN2A、GLS、DLAT)作为预后生物标志物构建预后模型,并使用回归系数构建预后评分:风险评分=0.22×DLAT (表达水平)+0.11×CDKN2A (表达水平)+0.03×GLS (表达水平)。Kaplan-Meier曲线显示,高风险评分HCC患者预后较差(P<0.05),用风险模型的时间依赖ROC曲线评价模型预测性能,1、3、5年的AUC分别为0.741,0.657,0.633。将年龄、性别、T分期、N分期、M分期、病理分型、CDKN2A、GLS和DLAT纳入构建列线图,校准图显示列线图预测和实际观察之间有良好的一致性。GLS、DLAT和CDKN2A与HCC免疫细胞浸润呈正相关,并与免疫检查点PDCD1、 CD274、 HAVCR2明显相关(均P<0.05)。进一步分析表明,HCC组织中CDKN2A、GLS和DLAT表达越高,患者巴塞罗那病理分期越晚,组织学分级越差(均P<0.05)。结论:与铜死亡相关的基因特征可以作为HCC患者潜在的预后预测因子,并可能为HCC治疗提供新的途径。
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