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高质量雉鸡基因组序列图谱构建和解析
上海交通大学农业与生物学院孟和教授团队采用多平台策略构建了染色体层级的雉鸡基因组序列图谱。相关成果发表于Molecular Ecology Resources。该研究首先明确了雉鸡与其他多种鸟类的系统发育关系,其次发现了一些钙离子相关基因可能参与了雉鸡的适应性进化与物种特性的形成,并且通过全基因组重测序分析在基因组中找到了与家养雉鸡体重相关的人工选择区域。此外,研究发现了雉鸡的免疫重要基因——主要组织相容性复合体(MHC)基因序列存在独特的排列模式,相较于家鸡祖先红原鸡存在3个大片段的染色体倒位,暗示着雉鸡免疫系统在进化过程中曾经经历过特殊的事件。
脂肪细胞死亡研究进展
西安交通大学医学部基础医学院心血管研究中心王胜鹏教授与德国马普所Stefan Offermanns等合作,在脂肪细胞死亡研究领域取得新进展。相关成果发表于Nature Communications。肥胖作为2型糖尿病、心血管疾病及癌症等众多疾病的危险因素,已成为世界公认的公共卫生问题。肥胖症中,脂肪组织发生动态重塑。为了检测肥胖过程中白色脂肪细胞的YAP和TAZ活性是否受到影响,科学家检测了YAP和TAZ的亚细胞定位以及YAP/TAZ靶基因在人和小鼠白色脂肪细胞中的表达,并证明人类和小鼠的肥胖伴随着白色脂肪细胞中YAP和TAZ的激活增加。
一种全新转录调控复合物INTAC——RNA聚合酶Ⅱ磷酸酶的鉴定
復旦大学附属肿瘤医院/生物医学研究院徐彦辉团队与陈飞团队合作,发现了一个全新的转录调控复合物INTAC(包含16个蛋白亚基,总分子量近1.5兆道尔顿),解析了INTAC的高分辨冷冻电镜结构,揭示了INTAC作为一个双功能酶同时具备RNA剪切和去磷酸化活性,可去除Pol Ⅱ的多个CTD磷酸化位点发挥转录抑制功能。相关成果发表于Science。基因表达的精密调控,对生命体的形成、发育以及各种生物学功能的维持至关重要;基因表达的紊乱与各种疾病的发生息息相关。该项研究首次发现PP2A这一最重要的磷酸酶可直接调控转录,拓展了磷酸酶与转录调控这两个重要研究领域的研究范畴。
蛇床子素舒张气道平滑肌的分子机制
中国科学院生物物理研究所卫涛涛课题组、美国克瑞顿大学屠亚平课题组、中国药科大学曹征宇课题组合作揭示蛇床子素舒张气道平滑肌的分子机制。相关成果发表于Molecular Biology and Evolution。传统中药蛇床子的主要活性成分蛇床子素(osthole),可以舒张气道平滑肌、抑制哮喘疾病模型的气道高反应性。研究团队从动物模型、组织切片、培养细胞及酶学反应等不同水平确定了蛇床子素的作用靶点是蛋白磷酸二酯酶4(PDE4);进一步通过共结晶及X射线晶体衍射解析了蛇床子素与PDE4相互作用的结构基础,阐明了蛇床子素抑制PDE4并舒张气道平滑肌的分子机制。
上海交通大学农业与生物学院孟和教授团队采用多平台策略构建了染色体层级的雉鸡基因组序列图谱。相关成果发表于Molecular Ecology Resources。该研究首先明确了雉鸡与其他多种鸟类的系统发育关系,其次发现了一些钙离子相关基因可能参与了雉鸡的适应性进化与物种特性的形成,并且通过全基因组重测序分析在基因组中找到了与家养雉鸡体重相关的人工选择区域。此外,研究发现了雉鸡的免疫重要基因——主要组织相容性复合体(MHC)基因序列存在独特的排列模式,相较于家鸡祖先红原鸡存在3个大片段的染色体倒位,暗示着雉鸡免疫系统在进化过程中曾经经历过特殊的事件。
脂肪细胞死亡研究进展
西安交通大学医学部基础医学院心血管研究中心王胜鹏教授与德国马普所Stefan Offermanns等合作,在脂肪细胞死亡研究领域取得新进展。相关成果发表于Nature Communications。肥胖作为2型糖尿病、心血管疾病及癌症等众多疾病的危险因素,已成为世界公认的公共卫生问题。肥胖症中,脂肪组织发生动态重塑。为了检测肥胖过程中白色脂肪细胞的YAP和TAZ活性是否受到影响,科学家检测了YAP和TAZ的亚细胞定位以及YAP/TAZ靶基因在人和小鼠白色脂肪细胞中的表达,并证明人类和小鼠的肥胖伴随着白色脂肪细胞中YAP和TAZ的激活增加。
一种全新转录调控复合物INTAC——RNA聚合酶Ⅱ磷酸酶的鉴定
復旦大学附属肿瘤医院/生物医学研究院徐彦辉团队与陈飞团队合作,发现了一个全新的转录调控复合物INTAC(包含16个蛋白亚基,总分子量近1.5兆道尔顿),解析了INTAC的高分辨冷冻电镜结构,揭示了INTAC作为一个双功能酶同时具备RNA剪切和去磷酸化活性,可去除Pol Ⅱ的多个CTD磷酸化位点发挥转录抑制功能。相关成果发表于Science。基因表达的精密调控,对生命体的形成、发育以及各种生物学功能的维持至关重要;基因表达的紊乱与各种疾病的发生息息相关。该项研究首次发现PP2A这一最重要的磷酸酶可直接调控转录,拓展了磷酸酶与转录调控这两个重要研究领域的研究范畴。
蛇床子素舒张气道平滑肌的分子机制
中国科学院生物物理研究所卫涛涛课题组、美国克瑞顿大学屠亚平课题组、中国药科大学曹征宇课题组合作揭示蛇床子素舒张气道平滑肌的分子机制。相关成果发表于Molecular Biology and Evolution。传统中药蛇床子的主要活性成分蛇床子素(osthole),可以舒张气道平滑肌、抑制哮喘疾病模型的气道高反应性。研究团队从动物模型、组织切片、培养细胞及酶学反应等不同水平确定了蛇床子素的作用靶点是蛋白磷酸二酯酶4(PDE4);进一步通过共结晶及X射线晶体衍射解析了蛇床子素与PDE4相互作用的结构基础,阐明了蛇床子素抑制PDE4并舒张气道平滑肌的分子机制。