黄瓜Ca^2+家族序列特征及其表达特性分析

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通过黄瓜基因组数据库,采用生物信息学方法获得15个黄瓜Ca^2+家族序列,并对其染色体位置、基因组位置、氨基酸长度、转录起始位点和Pfam匹配结构域数进行预测;利用RT-PCR方法对所有搜索到的Ca^2+家族基因进行组织特异性分析;对黄瓜植株进行低温处理,分析黄瓜Ca^2+基因家族的表达情况。结果显示:15个基因中除Csa021245未定位以外,其余均匀分布在1-6号染色体上,一致性为47.67%;Csa001688、Csa009857和Csa009360等3个基因的5′区出现CpG岛结构;组织表达特异性
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