【摘 要】
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为探究连翘叶绿体基因组特征及该属物种的系统进化发育关系,利用高通量测序技术对连翘长花柱与短花柱植株叶绿体基因组进行测序和功能注释,利用PCR对高通量测序结果进行验证.结果 显示:连翘长花柱与短花柱植株叶绿体基因组全长均为156386 bp,为典型的四段式结构.连翘叶绿体基因组注释到114个基因,包括80个蛋白编码基因,30个tRNA基因,4个rRNA基因.基因组56个简单重复序列(SSR)位点分析显示其SSR序列主要由A和T碱基组成.连翘叶绿体基因组编码区偏向使用A、T碱基,但整体密码子偏好性较弱,主要表
【机 构】
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山西农业大学生命科学学院,山西太谷030801
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为探究连翘叶绿体基因组特征及该属物种的系统进化发育关系,利用高通量测序技术对连翘长花柱与短花柱植株叶绿体基因组进行测序和功能注释,利用PCR对高通量测序结果进行验证.结果 显示:连翘长花柱与短花柱植株叶绿体基因组全长均为156386 bp,为典型的四段式结构.连翘叶绿体基因组注释到114个基因,包括80个蛋白编码基因,30个tRNA基因,4个rRNA基因.基因组56个简单重复序列(SSR)位点分析显示其SSR序列主要由A和T碱基组成.连翘叶绿体基因组编码区偏向使用A、T碱基,但整体密码子偏好性较弱,主要表现在Arg和Ser的差异.与己公布的32种植物(包括14种连翘属)叶绿体基因组序列构建系统发育进化树,结果显示连翘的叶绿体基因组与产自山西泽州的连翘高度同源.连翘异型花柱具有相同的叶绿体基因组序列,推测连翘的异型花柱是由同型花演化而来.
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以温州蜜柑膨大期果实为材料,设置基质相对含水量为40％、30％和20％的3个胁迫处理,研究干旱对果实品质形成特点和柠檬酸调控相关转录因子表达模式变化;利用氘水(D2O)示踪法明确柑橘干旱复水后的水分吸收运输和分配规律.温州蜜柑果实膨大期干旱严重抑制果实外在品质的形成,干旱胁迫l0d后,果实横径、纵径、单果质量均显著下降,40 d时各处理横、纵径较对照减少18.33％～23.82％,单果质量降低45.17％～48.67％,各干旱处理间无显著差异.各处理干旱胁迫40 d时果实可溶性固形物显著增加47.7％～5
TIFY转录因子是陆地植物特有的转录因子,按照结构域特征共分为4个亚家族TIFY、PPD、JAZ、ZML,调控植物的生长发育过程.以茶树TIFY转录因子为研究对象,从茶树基因组数据库中共鉴定了22个CsTIFY转录因子家族成员,都包含了TIFY结构域.基因结构分析发现,大部分CsTIFY家族成员外显子数在5到12之间,同一亚家族所含Motif和外显子数相似.系统进化树表明,6个物种122个TIFY家族基因分为4个组,其中茶树与葡萄和杨树亲缘关系更近.启动子顺式作用元件分析发现CsTIFY家族含有大量响应S
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采集了77份云南省疑似感染莴苣褪绿病毒(lettuce chlorosis virus,LCV)的番茄样本,采用特异性反转录PCR扩增LCV次要外壳蛋白基因(minor coat protein,CPm)近全长序列,常规Sanger测序法测定相应片段序列,并对其进行遗传进化分析.结果 表明,LCV特异性反转录PCR扩增得到与预期大小(1.38 kb)一致的特异性条带;采集的77份番茄样本中LCV检出率为12.99％.测定的LCV CPm;发育分析表明,所有LCV分离物可分为3个亚簇,具有明显的地域特性,其
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