当前，全国统一电力市场和全国碳交易市场正在同步改革，发电企业面临着在电力市场和碳市场竞争的双重压力。如何适应新的市场环境，在碳-电耦合市场中统筹考虑市场细则及自身电源特征制定竞价计划，是当前发电企业亟须解决的实际问题。针对这一问题，提出了考虑国家核证自愿减排量（CCER）机制的碳-电耦合市场中水火电协同竞价模型。该模型详细考虑了碳市场中的碳清缴、CCER抵消、违约惩罚等机制及电力市场特征，兼顾梯级水电站水力-电力的时空耦合联系及非凸非线性的发电运行特征，描述了水火电在耦合市场中的协同竞价要素。针对模型中的非凸及逻辑表达式，引入多种线性化方法将其转为混合整数二次规划问题予以求解。以中国澜沧江流域梯级水电站与火电站为工程背景验证了模型的有效性，进一步分析了碳-电耦合市场机制的作用效果。