目的：观察上下两济丹联合经颅磁刺激治疗心肾不交型老年慢性失眠的临床疗效。方法：将94例心肾不交型老年慢性失眠患者以随机数字表法分为对照组和观察组，每组47例。对照组予以经颅磁刺激治疗，观察组予以上下两济丹联合经颅磁刺激治疗，2组均治疗4周。比较2组临床疗效及不良反应发生率，观察2组治疗前后睡眠质量与血清S100B、神经元特异性烯醇化酶（NSE）水平的变化。结果：观察组总有效率93.62%，高于对照组76.60%（P＜0.05）。治疗后，2组睡眠总时间均较治疗前延长（P＜0.05），觉醒次数均较治疗前减少（P＜0.05），失眠严重程度指数量表（ISI）评分均较治疗前降低（P＜0.05）；观察组睡眠总时间长于对照组（P＜0.05），觉醒次数少于对照组（P＜0.05）,ISI评分低于对照组（P＜0.05）。治疗后，2组血清S100B、NSE水平均较治疗前降低（P＜0.05），观察组S100B、NSE水平均低于对照组（P＜0.05）。观察组不良反应发生率10.64%，与对照组6.38%比较，差异无统计学意义（P＞0.05）。结论：上下两济丹联合经颅磁刺激治疗心肾不交型老年慢性失眠可增强疗效，改善患者的睡眠质量，降低血清S100B、NSE水平，且安全性良好。