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采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，对铜陵牡丹和垫江牡丹进行过氧化物酶（POD）和酯酶（EST）同工酶的测定分析。结果显示，两个品种牡丹的POD同工酶酶谱共栓出7条酶带，其中铜陵牡丹分离带为7条，垫江牡丹为3条，铜陵牡丹多出4条特有酶带，且活性较强；EST酯酶同工酶中，两种牡丹共有酶带为5条，活性上略有差异，铜陵牡丹特有2条酶带，垫江牡丹特有1条酶带。