基于TCGA数据库分析DARS2在膀胱癌中的临床意义

来源 :分子诊断与治疗杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wymanszeto
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目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,分析线粒体天冬氨酰-tRNA合成酶2(DARS2基因在膀胱癌患者和正常组织中的表达差异,研究其与患者临床特征、预后相关性及参与膀胱癌的调节信号通路。方法 从TCGA数据库下载膀胱癌相关的表达资料和临床特征资料,使用R.4.0.3软件和Strawberry Perl 5.32.0.1提取膀胱癌组织和正常组织中DARS2的表达量数据,利用Mann-Whitney U检验比较两组间的表达差异。将DARS2基因表达量按照中位值分为高表达组和低表达组,采用卡方检验分析表达量与临床特征的关系。利用单因素和多因素cox回归分析对预后意义进行评估,使用Kaplan-Meier法进行生存分析并采用在线数据库验证,利用基因富集分析(GSEA)预测DARS2在膀胱癌中参与的信号通路。结果 膀胱癌组DARS2的表达量明显高于正常组,差异有统计学意义(P<0.05),DARS2在膀胱癌患者中的表达与Stage分期(P<0.05)和T分期(P<0.05)有关。DARS2(HR=2.08,95%CI:1.34~3.25,P<0.05)可作为膀胱癌的独立预后因素。DARS2高表达组的总生存率显著低于低表达组,差异有统计学意义(P<0.05),与OncoLnc在线数据库验证结果一致。GSEA富集分析表明DARS2主要参与细胞周期、RNA降解、核苷酸切除修复、错配修复、P53信号通路、DNA复制。结论 DARS2在膀胱癌患者中高表达,与Stage分期和T分期有关,可以作为导致膀胱癌预后不良的独立危险因子,并通过多种信号途径促进膀胱癌的发生发展。
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