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提出了一种基于双曲S变换识别励磁涌流和变压器内部故障的新方法。利用S变换具有优秀时频呈现能力和时频分辨率的特点，采用双曲窗函数，把励磁涌流和故障电流信号变换到相空间进行特征提取，从经过变换以后得到的时频等值线图可以发现二者具有明显不同的特征。通过计算H-S变换后的能量以及1-9层能量与1层能量的比值，发现比值6是区别励磁涌流和故障电流的阈值。仿真分析结果和动模试验均表明：H-S变换可以更清楚地反映信号的时频局部化特性，能准确识别励磁涌流；并且具有较好的抗干扰能力，在变换域易于信号和噪声的分离。