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肝的三主要有免疫力的混乱是自体免疫的肝炎(AIH ) ，主要胆汁性肝硬变(PBC ) 和主要致硬化的胆管炎(PSC ) 。这些疾病的变体形式通常被称为重叠症候群，尽管没有 standardised 定义。有重叠症候群的病人与 hepatitic 和胆汁郁积的浆液肝测试介绍并且有 AIH 和 PBC 或 PSC 的组织学的特征。AIH-PBC 重叠症候群是最普通的形式，影响有 AIH 或 PBC 的几乎 10% 成年人。AIH 和自体免疫的胆管炎(AMA 否定的 PBC ) 的单个案例重叠症候群也被报导了。