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本文采用9个重复性好、条带清晰的引物对散斑壳属（Lophodermium Chevall．）的15个菌株进行ISSR—PCR扩增。通过聚类分析，得出ISSR分析结果和表型形状的分析结果表现出较好的一致性，从而确定了形态学特征以及寄主种类差异等在散斑壳属种阶元分类上的重要性。同时说明了ISSR技术可以较好的应用于散斑壳属种内和种间亲缘关系及遗传多样性的分析。