【摘 要】
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目的探讨RNA编辑在小鼠心脏发育过程中的动态变化并对其功能影响进行分析预测。方法从ArrayExpress数据库获取小鼠心脏发育的转录组数据(E-MTAB-6798),使用SPRINT和ANNOVAR工具识别和注释RNA编辑位点,从编辑酶表达水平、编辑位点数、样本编辑水平和编辑指数方面描述RNA编辑的动态变化,并通过差异编辑及共编辑网络分析探究RNA编辑的功能和意义。结果在55个样本中共识别出122554个非冗余的RNA编辑位点,样本的编辑水平和编辑指数在小鼠心脏发育过程中变化明显,且出生两周后样本中的R
【机 构】
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复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系,复旦大学附属金山医院心内科
【基金项目】
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复旦大学附属金山医院青年科研启动基金(JYQN-JC-202010)。
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目的探讨RNA编辑在小鼠心脏发育过程中的动态变化并对其功能影响进行分析预测。方法从ArrayExpress数据库获取小鼠心脏发育的转录组数据(E-MTAB-6798),使用SPRINT和ANNOVAR工具识别和注释RNA编辑位点,从编辑酶表达水平、编辑位点数、样本编辑水平和编辑指数方面描述RNA编辑的动态变化,并通过差异编辑及共编辑网络分析探究RNA编辑的功能和意义。结果在55个样本中共识别出122554个非冗余的RNA编辑位点,样本的编辑水平和编辑指数在小鼠心脏发育过程中变化明显,且出生两周后样本中的R
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