【摘 要】
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目的高通量测序技术分析冷应激大鼠肝脏基因mRNA差异表达。方法将SPF级大鼠随机分为冷刺激组[（4±0. 05）℃]及常温对照组[（24±0. 05）℃],刺激24 h。采集2组大鼠肝脏组织并提取总RNA,应用Ⅲumina HiSeg平台测序,对筛选的差异表达基因进行基因功能（Gene Ontology,GO）注释及信号通路数据库（Kyoto Encyclopedia of Genes and G
【基金项目】
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中国博士后科学基金（2017M611404）； 黑龙江省自然科学基金资助项目（C2015041）； 黑龙江八一农垦大学博士科研启动基金（XDB-2016-09）;黑龙江八一农垦大学三横三纵项目（ZRCQC201804）；
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目的高通量测序技术分析冷应激大鼠肝脏基因mRNA差异表达。方法将SPF级大鼠随机分为冷刺激组[（4±0. 05）℃]及常温对照组[（24±0. 05）℃],刺激24 h。采集2组大鼠肝脏组织并提取总RNA,应用Ⅲumina HiSeg平台测序,对筛选的差异表达基因进行基因功能（Gene Ontology,GO）注释及信号通路数据库（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）分析,采用qRT-PCR验证随机筛选的基因mRNA表达水平。结果经测序分析,冷刺激组发掘新基因293个,其中244个有功能注释,差异表达基因98个;经GO分析,差异表达基因显著富集细胞过程、生物调控、代谢过程、细胞组分、细胞器、蛋白质运输等过程;经KEGG分析,大多数差异表达基因注释在原发性免疫缺陷、癌症形成过程、用于IgA生成的肠道免疫网络、细胞因子与细胞因子受体相互作用等通路,在MAPK、PI3K-Akt信号通路和内质网蛋白加工通路中表达量极高,在乙型肝炎和病毒感染通路表达量较低。与常温对照组比较,冷刺激组大鼠肝脏的多配体聚糖4（syndecan 4,Sdc4）及白蛋白（albumin,Alb）基因表达水平上调,差异有统计学意义（P <0. 05）。结论成功筛选冷应激大鼠肝脏差异表达基因,该类基因很可能参与了机体代谢及损伤修复等过程,为深入研究大鼠冷应激机制积累了数据。
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