基于高通量靶向测序的大鼠遗传质量检测方案建立

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目的:将高通量靶向测序运用于实验动物DNA单核苷酸多态性检测,为监测大鼠遗传质量与品系鉴定提供一种新的方法。方法:利用多重PCR技术,以不同品系大鼠为研究对象,选取了21条染色体上的90个单核苷酸多态性(SNP)位点,构建扩增子文库,并通过二代测序仪进行高通量测序,以生物信息学手段分析SNP位点状态。结果:对SHR、WKY、GK、F344共4个近交系及SD封闭群大鼠进行SNP分型,不仅能够检测出近交系大鼠纯合子的情况,还能很好的区分出不同品系的大鼠。结论:本实验建立了一条高通量测序管道,实现了常见近交系大
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