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重建闭流型湖泊的水位及环境变化，可以为研究冰后期及全新世以来的气候变化及季风环流演变提供不可或缺的关键信息。对HQH4岩芯烧失量与川蔓藻化石种子的研究结果显示，黄旗海湖区在全新世到来之前的气候寒冷，湖面冰封期较长，夏季温度较低，致使湖泊的有机生产率和自生碳酸盐产量比全新世低很多。黄旗海从全新世早期起进入了稳定的湖泊发展阶段后有机生产率显著上升，自生碳酸盐产量同步大幅度增长。在10200—6800aBP期间，烧失量出现显著波动，很大程度上反映了气候发生暖湿-冷干-暖湿-冷湿的变化。在6800～3800aBP