基于TCGA全基因组RNA测序数据集探索结肠腺癌发病机制的研究

来源 :结直肠肛门外科 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lifengxing0628

【摘要】

：

目的通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中结肠腺癌(COAD)患者癌组织和癌旁正常结肠组织的全基因组RNA测序数据集进行富集分析(GSEA),探索结肠腺癌发病的相关机制。方法从TCGA

【作者】

：

龚艺贞邓腾廖锡文王向坤马辉

【机构】

：

广西医科大学第一附属医院结直肠肛门外科,广西医科大学附属肿瘤医院神经外科,广西医科大学第一附属医院肝胆外科

【出处】

：

结直肠肛门外科

【发表日期】

：

2019年2期

【关键词】

：

结肠腺癌 TCGA GSEA

【基金项目】

：

广西壮族自治区教育创新计划项目(YCBZ2018036)

下载到本地 , 更方便阅读

下载此文赞助VIP

声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架

论文部分内容阅读

目的通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中结肠腺癌(COAD)患者癌组织和癌旁正常结肠组织的全基因组RNA测序数据集进行富集分析(GSEA),探索结肠腺癌发病的相关机制。方法从TCGA数据库下载COAD相关的RNA测序数据集。以COAD患者癌组织和癌旁正常结肠组织作为分组变量,以“c2.cp.kegg.v6.2.symbols.gmt”和“c5.all.v6.2.symbols.gmt”作为参照基因集,使用GSEA2-2.2.3版进行分析,以|NES|>1、Norminal-P<0.05和错

其他文献

一种降低邻道干扰的不停车收费系统

随着城市车辆逐年增多,电子不停车收费系统(ETC)的应用日益广泛,大规模建设ETC同向多车道的需求越来越迫切,而多车道应用带来的邻道干扰问题则成为亟待解决的问题。文中提出

期刊

电子不停车收费邻道干扰向前兼容集中控制

躯体化症状自评量表在心脏神经症诊断中的应用

目的：探讨由我们编制的检查综合医院患者心理问题的躯体化症状自评量表(SSS)、焦虑自评量表(SAS)和抑郁自评量表(SDS)之间的相关性及差异性。方法：采用SSS、SAS和SDS对430例综

会议

患者心理障碍心脏神经症躯体化症状医学行为学

改革开放以来党中央的军民融合思想与实践——兼谈对毛泽东相关军事思想的继承和发展

2017年6月,习近平同志在主持召开中央军民融合发展委员会第一次全体会议时深刻阐述了如何走出一条中国特色军民融合路子,同时强调:“把军民融合发展上升为国家战略,是我们长

期刊

军民融合军事思想国防动员体制军民结合国防科技工业寓军于民军民融合发展毛泽东继承和发展党中央改革开放以来思想与实践

加工过程物理仿真技术研究

加工过程仿真是虚拟制造的底层关键技术,同时也是数字化制造系统的重要组成部分,而物理仿真是其中的研究重点和难点.建模难,通用性和实用性差是目前物理仿真中存在的主要问题

期刊

加工过程仿真物理仿真加工过程建模

一直秉承合家欢，是它对中国动画电影产业的最大贡献

2014年寒假档，电视动画片《熊出没》的首部动画电影《熊出没之夺宝熊兵》上映，一举创造了2.48亿元的国产动画电影票房新纪录。该片推翻了电视动画简单对抗的剧情模式，改走美国大

报纸

书架不是风景

<正>如今,书架已经成了一些领导干部办公室中一道不可或缺的风景。那些满满当当摆放着的书似乎在告诉人们,主人是一位爱书之人,或是一位饱学之士,让人不免肃然起敬。笔者并不

会议

持续质量改进对血透患者并发症的影响

目的的研究应用持续质量改进(continuons quality improvement CQI)的方法对透析患者并发症的影响。方法选择我院CQI前维持性血透患者42例,分析并发症的发生率及分类,采用计

期刊

持续质量改进血液透析并发症

《国际企业管理》课程教学改革调查研究

为了在国家＂一带一路＂和高等教育＂双一流＂背景下提升工商管理专业国际化人才的培养效果,文章运用访谈调查法和问卷调查法,对安徽财经大学工商管理专业《国际企业管理》课程进行调

期刊

国际化国际企业管理教学改革教学方法

同时蒸馏萃取法分析4种台式乌龙茶香气成分

以4个台茶品种金萱、翠玉、软枝乌龙、四季春以及鸟龙茶对照种黄金桂（黄校）的鲜叶为原料，按台式乌龙茶工艺制作成乌龙茶，采用同时蒸馏萃取-气质联用法分析香气成分，并比较它们香气

期刊

同时蒸馏萃取法金萱翠玉软枝乌龙四季春气质联用分析

长期透析患者内瘘护理过程中应用红外理疗仪对内瘘护理效果的改善及并发症的防治

目的总结分析维持长期性血液透析患者动静脉内瘘使用过程中的并发症，综合分析目前对内瘘并发症的预防具有积极有效作用的护理干预方法，对比得到红外理疗仪在延长内瘘的使用寿命

期刊

血液透析内瘘护理红外理疗仪内瘘并发症

基于TCGA全基因组RNA测序数据集探索结肠腺癌发病机制的研究

与本文相关的学术论文