【摘 要】
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[目的]通过大数据分析了解NAT1mRNA和蛋白质在结肠癌中的表达情况及对临床预后的影响.[方法]检索当前世界上几个主要的肿瘤生物信息数据库(Oncomine、TCGA、CPTAC等)中有关NAT1的相关数据,对其进行生物信息学分析,对NAT1在结肠癌中的临床作用进行荟萃分析.[结果]443项有关NAT1的不同类型研究结果纳入Onco-mine数据库,NAT1表达在肿瘤与其对照组织中有统计学差异的结果有37项,其中NAT1高表达的有12项,低表达的有25项.涉及到结肠癌的研究共有15项,且在结肠癌组织中均
【机 构】
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武汉大学人民医院药学部,湖北武汉430060;华中科技大学同济医学院附属武汉中心医院中西医结合肿瘤科,湖北武汉430014;武汉大学人民医院病理科,湖北武汉430060
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[目的]通过大数据分析了解NAT1mRNA和蛋白质在结肠癌中的表达情况及对临床预后的影响.[方法]检索当前世界上几个主要的肿瘤生物信息数据库(Oncomine、TCGA、CPTAC等)中有关NAT1的相关数据,对其进行生物信息学分析,对NAT1在结肠癌中的临床作用进行荟萃分析.[结果]443项有关NAT1的不同类型研究结果纳入Onco-mine数据库,NAT1表达在肿瘤与其对照组织中有统计学差异的结果有37项,其中NAT1高表达的有12项,低表达的有25项.涉及到结肠癌的研究共有15项,且在结肠癌组织中均为低表达.涉及到NAT1在结肠癌和正常组织中的mRNA表达的样本共有565例.Oncomine数据库中9项研究数据集的二次分析结果表明NAT1在结肠癌中的表达低于正常组织(P＜0.05).TCGA数据库和CPTAC数据库提示NAT1在结肠癌中的mRNA和蛋白水平均呈现低表达(P＜0.05).另外,免疫组织化学显示NAT1在结肠癌组织中表达较弱或呈阴性,而在正常组织中表达较强或中等.NAT1表达和年龄、种族、性别、体重、肿瘤分期无关,而与肿瘤的组织病理分型可能存在一定相关性(P＜0.05).不仅如此,生存分析发现高表达NAT1的患者预后较好(P＜0.05).[结论]NAT1的mRNA和蛋白水平在结肠癌组织中呈现低表达,和结肠癌不良预后相关.
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旨在研究斑马鱼(Danio rerio)mapk1基因对tp53基因的调控作用.通过生信网站分析斑马鱼tp53启动子序列与mapk1基因CDS序列,构建斑马鱼tp53启动子荧光素酶报告基因质粒pGL3-tp53-Luc和mapk1表达质粒pCMV-Tag2B-mapk1.利用Luciferase实验验证tp53启动子报告基因的活性,以及mapk1基因对tp53基因的活性影响.结果显示,斑马鱼tp53基因启动子区无CpG岛位点,包含Oct-1(TATGTAAAGC)、Sp-1(AGATCCCGCC)、c-J
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