陆川猪PLIN5基因克隆和序列分析

来源 :黑龙江畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dajianshi
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为了研究陆川猪背最长肌围脂滴蛋白5(PLIN5,Perilipin5)基因的结构和功能,试验对陆川猪PLIN5基因进行RT-PCR扩增,所得产物经转化获得含目的基因PLIN5的重组质粒p MD19-T-PLIN5,经菌落PCR和测序鉴定正确后,利用生物信息学方法对陆川猪PLIN5基因的结构、理化性质及其编码蛋白信号肽、跨膜结构、亚细胞定位等进行了分析,并讨论了陆川猪与其他物种PLIN5氨基酸序列的进化关系。结果表明:PLIN5基因CDS区长1 377 bp,编码458个氨基酸,与NCBI上公布的野猪PLIN5基因序列中的CDS区存在4个碱基差异,均为错义突变。陆川猪PLIN5蛋白不存在信号肽,没有跨膜结构域,不存在N糖基化位点;二级结构中α-螺旋占47.16%,无规则卷曲占43.67%,延伸链占9.17%;PLIN5基因在不同物种及进化的过程中具有较高的保守性。说明陆川猪PLIN5基因编码的蛋白符合一般Perlipin超家族的结构特征,或许可用来改善陆川猪肉质性状。
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