【摘 要】
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目的 :采用高通量转录组测序技术,通过生物信息学手段,初步筛选并鉴定结肠直肠癌病人术前新辅助治疗效果相关基因,并进行差异表达分析,为进一步阐明结肠直肠癌新辅助治疗敏感
【机 构】
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上海交通大学医学院附属瑞金医院外科上海消化外科研究所;
【基金项目】
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上海市科委项目(14411950504);上海申康中心市级医院临床技能与临床创新能力3年行动计划(16CR3064B);上海交通大学医学院博士研究生创新基金(BXJ201709)
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目的 :采用高通量转录组测序技术,通过生物信息学手段,初步筛选并鉴定结肠直肠癌病人术前新辅助治疗效果相关基因,并进行差异表达分析,为进一步阐明结肠直肠癌新辅助治疗敏感性的分子机制提供基础。方法:22例接受标准术前新辅助治疗的结肠直肠癌病人,根据肿瘤消退评级分为敏感组9例,不敏感组13例。提取肿瘤组织RNA,构建转录组文库,采用高通量测序平台进行测序。结合生物信息学等相关手段,筛除错误发生率(<0.05)的基因后对比组装,对得到的转录组样本进行分类和注释。对差异表达基因特征进行分析。结果:初步建立结肠直肠癌新辅助治疗敏感性基因数据库。从22例转录组标本中,发现89个基因表达出现显著上调,112个基因出现显著下调。结论:高通量测序分析提示,这些基因表达变化可能与结肠直肠癌新辅助治疗敏感性密切相关。
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