尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种中FoGAS1基因的克隆与序列分析

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采用PCR和RT-PCR的方法,从尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种中克隆得到了FoGAS1基因的DNA及cDNA序列,并运用生物信息学的方法对该基因所编码的氨基酸序列进行分析,预测其编码蛋白质的结构和功能。结果表明,FoGAS1基因全长1 672 bp,其中开放阅读框全长1 623 bp,编码含有540个氨基酸残基的蛋白质,该蛋白分子量为58398.1,等电点pI=4.83,为性质稳定的亲水性蛋白。FoGAS1蛋白为跨膜蛋白,含有22个丝氨酸磷酸化位点,2个苏氨酸磷酸化位点,8个酪氨酸磷酸化位点。该蛋白在C端有一个信号肽结构,为一种分泌蛋白。通过系统进化树分析,该蛋白在不同种属镰刀菌中高度保守。 The DNA and cDNA sequence of FoGAS1 gene was cloned from Fusarium oxysporum cv. No.4 using the methods of PCR and RT-PCR. The amino acid sequence of FoGAS1 gene was amplified by bioinformatics To analyze and predict the structure and function of the encoded protein. The results showed that the FoGAS1 gene was 1 672 bp in length, of which the open reading frame was 1 623 bp in length and encoded a protein of 540 amino acid residues with a molecular weight of 58398.1 and an isoelectric point pI of 4.83, which was a stable hydrophilic Sexual protein. The FoGAS1 protein is a transmembrane protein containing 22 serine phosphorylation sites, two threonine phosphorylation sites and eight tyrosine phosphorylation sites. This protein has a signal peptide structure at the C-terminus and is a secreted protein. By phylogenetic tree analysis, the protein is highly conserved among Fusarium species of different species.
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