【摘 要】
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以黄瓜为试材,根据基因响应铜(Cu)的表达模式及保守性,采用基因克隆和生物信息学方法,对筛选获得的黄瓜凝集素受体激酶基因(CsLecRK)进行克隆及生物信息学分析,并对该基因在C
【机 构】
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东北农业大学农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,东北农业大学园艺园林学院,
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以黄瓜为试材,根据基因响应铜(Cu)的表达模式及保守性,采用基因克隆和生物信息学方法,对筛选获得的黄瓜凝集素受体激酶基因(CsLecRK)进行克隆及生物信息学分析,并对该基因在Cu胁迫条件的表达模式进行分析,以期探索黄瓜耐铜(Cu)的分子机制。结果表明:该基因cDNA全长为2 121 bp,编码706个氨基酸;理论分子量为78.36kDa,等电点为7.76。NCBI Blastp分析与进化树分析均表明,CsLecRK编码的蛋白与甜瓜的LecRK序列同源性最高(95%),进化距离最近。qRT-PCR分析表明,CsLecRK在Cu胁迫条件下表达明显下调。
Using cucumber as the test material, the cloned lectin receptor kinase gene (CsLecRK) was cloned and bioinformatics analyzed by gene cloning and bioinformatics methods according to the gene expression patterns and conservation of copper (Cu) , And analyzed the expression pattern of the gene under Cu stress conditions in order to explore the molecular mechanism of cucumber Cu resistance. The results showed that the full-length cDNA of this gene was 2 121 bp, encoding 706 amino acids; its theoretical molecular weight was 78.36 kDa and its isoelectric point was 7.76. NCBI Blastp analysis and phylogenetic tree analysis showed that the protein encoded by CsLecRK has the highest homology (95%) with the LecRK sequence of melon and the closest evolution distance. qRT-PCR analysis showed that CsLecRK was down-regulated under Cu stress.
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