基于网络药理学结合GEO数据探讨木白散治疗消化性溃疡的作用机制

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目的:利用网络药理学理论结合高通量基因表达数据库(gene expression omnibus, GEO)数据分析木白散治疗消化性溃疡的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)数据库中搜索木白散药物活性成分筛选靶基因;以“Pepticulcer”为关键词在Genecards、OMIM以及GEO数据库中检索疾病相关基因;获取药物-疾病共同基因;利用R3.5.2软件对共同基因进行基因本体功能注释(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析;绘制PPI蛋白互作网络并获取核心基因,利用GEO基因表达矩阵验证部分核心基因的差异表达结果。结果:木白散152个有效活性成分,335个靶点;消化性溃疡靶基因1 015个,药物-疾病共同基因92个,筛选出前列腺素G/H合酶2(prostaglandin G/H synthase 2,PTGS2)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6),IL-10、C-C基序趋化因子2(C-C motif chemokine ligand 2,CCL2)、胞间黏附分子1(cell adhesion molecule1,ICAM1)、血管细胞黏附蛋白1(vascular cell adhesion molecule-1,VCAM1)、基质金属蛋白酶-9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)等35个核心基因,GEO基因表达矩阵分析发现,PTGS2、IL-6、IL-10等部分核心基因在消化性溃疡患者中显著高表达,GO功能注释和KEGG通路富集主要富集在抗氧化活性、MAPK、NF-κB、IL-17、肿瘤坏死因子等信号通路中。结论:木白散能够通过山柰酚、槲皮素、黄芩素等成分作用于PTGS2、IL-6、MMP-9等基因,调控MAPK、NF-κB、IL-17等信号通路,抑制炎症反应,抑制内皮细胞增生,治疗消化性溃疡。
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