构建基于铁死亡相关长链非编码RNA的胆管癌预后模型

来源 :中国实验诊断学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangkaixin
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目的 在胆管癌(CCA)中用铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)建立有较好的预测能力的预后模型。方法 从TCGA数据集下载CCA的转录组RNA-seq数据和相应的临床数据。采用Pearson相关法筛选与铁死亡相关的差异表达的lncRNAs。单因素Cox回归分析用来筛选与预后相关的lncRNAs。通过多因素回归分析构建预后模型,采用受试者工作特征曲线(ROC)下面积和Kaplan-Meier曲线对模型进行评价。结果 筛选出3个铁死亡相关的差异表达lncRNAs:LINC01714、LINC02997和LINC01621。基于这3个lncRNAs构建的预后模型,预测1年、3年、5年生存率的ROC曲线下面积分别为0.81、0.81和0.82。结论 本研究基于铁死亡相关lncRNAs建立了一个预后模型预测CCA患者的生存概率,挖掘了有潜力作为CCA患者预后标志物的lncRNAs。
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