肝癌血浆游离DNA甲基化谱检测及临床意义

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目的:在外周血游离DNA中筛选肝癌特异的甲基化谱。方法:收集55例肝癌和54例慢性肝病患者血浆标本,应用甲基化特异性PCR方法检测血浆游离DNA的12个抑癌基因甲基化状态。结果:在肝癌组中,APC、p16、GSTP1、Cyclin D2、LHX1、TFPI2、DKK2、DKK3、SFRP2、14-3-3 sigma、ppENK、NPTX2基因的甲基化频率分别为78.18%、63.64%、58.18%、49.09%、49.09%、47.27%、40.00%、18.18%、16.36%、9.09%、7.27%和5.45%,而在慢性肝病组中,各基因的甲基化频率分别为27.78%、22.22%、7.41%、3.70%、16.67%、37.04%、37.04%、11.11%、20.37%、7.41%、7.41%和9.26%。APC、Cyclin D2、TFPI2、DKK3和GSTP1基因在肝癌组中的甲基化频率高于慢性肝病组(P<0.01)。将它们组成5基因甲基化谱,肝癌组甲基化指数(中位值为0.6,IQR 0.4~0.8)显著高于慢性肝病组(中位值为0.2,IQR 0~0.2)。在肝癌组中,甲基化指数与患者年龄具有相关性,年龄大者甲基化指数较高,而甲基化指数与其它临床病理参数未见相关性。甲基化指数与肝癌患者的无瘤生存期及总体生存期均未见相关性。结论:该甲基化谱可能成为肝癌辅助诊断的核酸标志物。
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