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利用SSR分子标记方法研究28个玉米自交系的遗传变异。分析四川地方玉米种质的遗传基础，并进行SSR聚类分析，探讨四川地方玉米种质与国内主要杂种优势群的关系。结果表明：大部分四川地方玉米种质均可被划分到常见的几大杂种优势群中去，少数地方玉米自交系可形成单独的类群，四川地方玉米种质具有广泛的遗传基础；SSRs能较真实地揭示自交系间的遗传多样性，可以认定是进行杂种优势类群划分的有效分子标记方法。