基于生物信息学方法鉴定头颈部鳞状细胞癌的关键基因及信号通路

来源 :中国中西医结合耳鼻咽喉科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:stenvenxin123
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目的采用生物信息学方法筛选头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)的关键基因及信号通路,挖掘HNSCC早期诊治及预后分析的潜在分子标志物。方法从GEO数据库中下载5组HNSCC相关表达谱芯片数据,利用R语言中的软件包筛选在HNSCC与癌旁正常组织中呈现差异性表达的基因,对差异基因进行系统的生物信息学分析。结果本研究共鉴定了215个差异基因;其中上调基因共计79个,主要在40个GO条目(P<0.01)与14条信号通路(P<0.05
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