多重PCR诊断猪5种繁殖障碍性疾病的方法研究

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本实验建立了一种同时检测5种猪病毒性繁殖障碍病原体的多重PCR方法。采用Primer Premier 5.0和Oligo 6.0引物设计软件根据GenBank中已发表的PPV的NS1基因、PCV2的ORF2、JEV的NS1基因、PRRSV的M基因以及PRV的gE基因序列设计了5对引物;分别扩增长度为750bp、494bp、475bp、363bp、178bp的特异性片段。通过对影响PCR的几个主要因素(包括反应Buffer、反应的退火温度、Taq DNA聚合酶浓度、引物浓度、Mg2+浓度等)进行优化,建立了灵敏检测这5种疾病的单项PCR方法;同时,还以PCV2为例就不同DNA抽提方法对扩增效率的影响进行了比较研究,通过比较确定了最佳的模板DNA抽提方法;对多联PCR反应中的Taq DNA聚合酶浓度、引物浓度和Mg2+浓度等进行优化后,建立了在相同反应程序下通过二联和三联两个反应体系(PPV-JEV,PCV2-PRRSV-PRV)对这5个核酸片段进行有效扩增的多重PCR方法。敏感性实验表明二联PCR最低检测限为:40.7TCID50PPV,15.5TCID50JEV;三联PCR最低检测限为:389TCID50PRRSV、245TCID50PRV,最低也能检测到经10-4稀释的PCV2抽提的DNA。实验表明该方法能够对PRV的野毒株和gE基因缺失疫苗株进行鉴别,同时能够区别PCV1和PCV2的感染;对PRV-SA215株、PCV1的核酸和健康猪淋巴结核酸抽提物均不能扩增出任何条带。利用该方法对采自四川、重庆、广西、广东、福建等发病猪场的30个病料进行了检测,检测结果再与单项PCR方法检测结果相比较,两者平均阳性符合率为93.3%。表明该方法是一种高度敏感、特异的检测方法,可以运用于临床诊断。
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