绒山羊皮肤毛囊发育不同时期初级、次级毛囊比较转录组学研究

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内蒙古绒山羊具有优良的产绒性状,是宝贵的种质遗传资源,因此研究绒山羊的绒毛发育机理,探寻与绒毛生长相关的重要候选基因就显得尤为重要。本试验采用高通量测序技术,选取3只内蒙古白绒山羊绒毛发育不同时期(生长期11月份、退行期1月份、休止期3月份)体侧部皮肤初级毛囊和次级毛囊各3个RNA样本,等量混合后进行转录组测序,并对结果进行生物信息学分析及qRT-PCR验证。试验结果显示:1、试验分别对3只不同生长时期绒山羊的初级、次级毛囊进行了组间和组内的差异基因筛选,共得到9组差异基因,并对差异基因进行了GO和Pathway分析。GO分析显示:显著富集的条目大多与组织细胞外基质、核糖体结构组成、细胞平移伸长、胞质小核糖体、肌动蛋白及维生素K的代谢过程有关。Pathway分析显示:差异基因主要在核糖体代谢、氨基酸代谢、维生素代谢、硫代谢、新霉素生物合成等功能上影响显著。2、试验对绒山羊不同生长时期初级、次级毛囊组内进行差异基因筛选,发现这些基因都有8种连续的趋势变化,分别是:down down down: up up down: down up down down up up: up down dowm; up down up:down down up: up up up;且在初、次级毛囊组内前三种趋势都较为显著。对这8中趋势的差异基因进行分析研究,将对挖掘绒山羊毛囊(尤其是次级毛囊)周期性生长调控机理提供有力依据。3、试验采用qRT-PCR技术对绒山羊毛囊发育的11月份及3月份的LGR5和SOSTDC1基因的转录组测序结果进行验证。结果显示,待测基因LGR5.SOSTDC1在绒山羊毛囊发育的11月份相对表达量显著高于3月份。这与测序结果基本一致。说明测序结果真实有效。
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