目的:宫颈癌作为女性生殖系统最常见的恶性肿瘤,病理类型主要分鳞状细胞癌和腺癌,其中宫颈鳞状细胞癌占80%,宫颈腺癌占5—20%,两者的发病特征、治疗效果、预后转归也不尽相同。因此我们分析了宫颈癌组织与细胞之间的异同点,在此基础上,我们确定了可能与宫颈鳞癌和腺癌进展相关的关键基因以寻找潜在的标志物或治疗靶点。方法:从UCSC平台获取TGCA及GTEx数据库中宫颈癌组织与正常宫颈组织的基因表达谱数据及临床资料,确定宫颈鳞癌和腺癌患者的癌组织与正常人宫颈组织之间的差异表达基因（DEGs）。宫颈鳞癌Siha和腺癌He La细胞株RNA-Seq文库的构建和测序由北京诺维基因科技有限公司（北京,中国）进行。然后,通过DAVID生物信息学数据库进行DEGs潜在功能的分析。STRING在线网站构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,Cytoscape软件（版本3.9.1）对PPI网络行可视化分析,Hub插件（2.0.0版）用于识别PPI网络的中枢基因。通过R软件分析中枢基因表达水平与宫颈鳞癌和腺癌患者预后之间的相关性,并通过TIMER2.0探索了生存相关基因表达与免疫浸润之间的关联。结果:在本研究中,我们发现宫颈鳞癌和腺癌组织中存在1398个DEGs,其中与腺癌相比较,鳞癌中536个DGEs相对显著上调,662个DEGs相对显著下调;与He La细胞相比,Siha细胞中有6869个DEGs,其中3221个DEGs相对显著上调,3648个DGEs相对显著下调。生物信息学分析表明,不同类型宫颈癌细胞株与临床组织之间在分子表达水平及生物学过程具有一些差异,基于此我们分析了两者之间共同的DEGs,通过PPI网络分析,我们确定了鳞癌和腺癌中各10个中枢基因,鳞癌的中枢基因包括EGFR、ERBB2、IL1B、MMP9、NOTCH1;腺癌的中枢基因包括IL1B、MMP9、EPCAM、SOX9、CAV1。生存分析显示ERBB2和EGFR的表达与宫颈腺癌患者的预后呈负相关;MMP9与宫颈鳞癌患者预后呈负相关,SOX9、CAW1、IL-1B基因则呈正相关。结论:在本研究中,我们确定了宫颈鳞癌和腺癌之间的DEGs,以及组织与细胞之间的异同点;此外,我们还确定了鳞癌和腺癌中各10个中枢基因。本研究可能为鳞癌和腺癌的预后提供新的生物标志物。