随着我国社会主义市场经济的高速发展，居民收入差距日益拉大。其中，公共部门与非公共部门的工资差异表现突出。公共部门与非公共部门之间的工资差异关系到社会人力资本配置的效率与公平，这一问题值得高度关注。公共部门与非公共部门的工资决定机制不同，引起工资差异的原因错综复杂。同时，公共部门与非公共部门的工资差异随着我国经济社会的发展而呈现新的特征。　　本研究在前人研究成果的基础上，选取中国综合社会调查(CGSS)2012年数据，通过对Mincer工资模型的改进建立了公共部门与非公共部门的工资函数方程，并将公共部门细分为党政机关和事业单位，运用RIF无条件分位数回归方法，深入分析党政机关、事业单位和非公共部门的工资分布上的差异特征。在此基础上，借鉴Oaxaca-Blinder分解方法分别对党政机关与非公共部门、事业单位与非公共部门、党政机关与事业单位进行工资差异分解，进一步探讨工资差异的形成原因。　　研究发现:公共部门与非公共部门工资差异随工资分位数的上升而缩小;在中低工资分位上，公共部门相比非公共部门享有较大的工资优势;党政机关与非公共部门的工资差异大于事业单位与非公共部门的工资差异;特征效应是公共部门与非公共部门的工资差异的主要原因;在高工资分位上，非公共部门相比公共部门具有工资回报率优势。因此，为促进建立公平合理的工资决定机制，本研究建议加大工资调查力度，纠正认识误区;加快公共部门工资改革步伐，提高对中高端人才的吸引力。