南阳牛μ-CAPN多态性与肉质性状关联性分析

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μ-CAPN (Calpain1)即依钙蛋白酶,是广泛存在于动物体内的一种特异性依赖钙激活的中性半胱氨酸巯基内肽酶。在活体肌肉组织内,钙激活酶是导致肌纤维蛋白降解的主要因素,也是宰后肌肉成熟过程中肌原纤维降解的主要因素,直接关系到肉的嫩化程度。本实验以70头南阳牛为研究材料,以μ-CAPN基因为肉质性状的候选基因,采用DNA测序、PCR-SSCP等技术,研究了μ-CAPN基因5’-UTR、外显子9(CAPN316)、14(CAPN530)和内含子1(CAPN5331)、17(CAPN4751)和21(CAPN4753)区基因序列的单核苷酸多态性与南阳牛肉质性状的关联性,以期为南阳牛的改良和利用以及南阳牛肉用新品系的培育提供参考。研究结果如下:1、应用PCR-SSCP技术对μ-CAPN基因5’-UTR、外显子14(CAPN530)、内含子1(CAPN5331)、17(CAPN4751)等位点的分析没有发现多态性。2、μ-CAPN基因CAPN316位点为低度多态,经卡方分析发现,群体在该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态。等位基因G、C频率分别为93%和7%,基因型GG、GC、CC的频率分别为分别为87%、11%和2%。与群体的肉质性状比较发现,该位点与6小时的pH值显著相关,与滴水损失、蒸煮损失、肌内脂肪含量、剪切力和肌纤维直径无显著相关。但发现,在剪切力上,携带GG基因型的个体的牛肉比携带GC基因型的个体的牛肉的少2.8%,呈显著相关(P<0.05)。3、μ-CAPN基因CAPN4753位点也处于低度多态,卡方分析发现,该位点在群体中处于Hardy-Weinberg不平衡状态。等位基因A、C频率分别为8%和92%,基因型AA、AC、CC的频率分别为分别为3%、13%和84%。与群体的肉质性状比较发现,该位点与屠宰后1天内的剪切力显著相关,且携带AC基因型的牛的牛肉的剪切力比携带CC基因型的牛肉的剪切力小3.4%,差异极显著(P<0.01)。4、在组和基因型方面,发现基因型CAGG个体剪切力比CCGC基因型个体剪切力小4.2%,表现出差异性显著(P<0.05);基因型CAGG个体剪切力比CCGG型个体的剪切力小2.6%,差异不显著(P>0.05)。CCGC与CCGG基因型个体间在剪切力方面差异均不显著(P>0.05)。
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