目的N-myc下游调节基因1(NDRG1)在多种肿瘤中下调,并与其恶性生物学行为和不良预后呈正相关。本课题研究胃癌中NDRG1的表达,以及其与胃癌的临床病理特征、DNA甲基化、预后和相关信号通路之间的关系。方法1、从Pub Med、Web of Science和CNKI中下载关于NDRG1的文献,经过一定条件筛选后,使用Review Manager 5.2软件进行meta分析。2、使用Western blot方法检测16对胃癌和癌旁正常组织的NDRG1蛋白表达水平。3、使用q RT-PCR方法检测18对胃癌和癌旁正常组织的NDRG1 m RNA表达水平。4、构建组织芯片,使用免疫组化方法检测160例胃癌组织和86例癌旁正常组织的NDRG1蛋白表达水平,并研究NDRG1蛋白表达与病理特征之间的关系。5、从TCGA数据库中分别下载胃癌的转录组、临床病理和甲基化数据,并用perl和R软件处理原始数据。这些数据用来比较NDRG1 m RNA在正常和胃癌间的表达差异,并分析NDRG1 m RNA表达与胃癌的临床病理特征、启动子甲基化和甲基化位点之间的关系。6、从Kaplan-Meier Plotter数据库中下载NDRG1 m RNA在胃癌中的预后数据,并研究NDRG1 m RNA表达与预后之间的关系。7、使用TCGA胃癌病人的转录组数据,通过GSEA-3.0软件进行NDRG1相关的基因集富集分析(GSEA)。结果1、Meta分析的结果表明,NDRG1蛋白在胃癌中表达下调。NDRG1蛋白的表达与局部浸润、淋巴结转移、远处转移和TNM分期呈负相关(P<0.05),而与分化和预后呈正相关(P<0.05),与性别和年龄无关。2、TCGA和q RT-PCR结果表明,NDRG1 m RNA在胃癌中表达降低(P<0.05)。3、Western blot和免疫组化实验的结果显示,胃癌中NDRG1蛋白表达下调(P<0.05)。4、免疫组化结果表明,NDRG1蛋白表达与胃癌患者的肿瘤直径、浸润深度、淋巴结转移和淋巴管浸润呈负相关(P<0.05),与分化呈负相关(P<0.05),与Lauren分期有关(P<0.05),而与年龄、性别和远处转移无关(P>0.05)。5、TCGA数据分析显示,NDRG1 m RNA表达与胃癌浸润深度、TNM分期呈负相关。6、NDRG1 m RNA表达与启动子甲基化呈负相关(Cor=-0.3,P=8.282e-08),与部分甲基化位点呈负相关(Cor≤-0.3)。7、Kaplan-Meier Plotter数据显示,NDRG1 m RNA下调与胃癌的不良预后呈正相关(P<0.05)。8、基因富集分析显示,NDRG1可以富集在肿瘤、Notch、PPAR、ERBB、粘附连接和紧密连接信号通路(P<0.05)。结论1.胃癌中NDRG1表达下调,其与基因启动子甲基化有关。2.NDRG1与胃癌恶性病理生物学行为和不良预后呈负相关,其通过Notch、PPAR、ERBB、粘附连接和紧密连接等信号通路发挥抑癌作用。3.NDRG1可以作为胃癌发生、演进和预后的分子标志物。