水稻（Oryza sativa L．）是世界上最重要的粮食作物之一，改善水稻株型、利用水稻亚种间杂种优势、培育水稻抗病品种为水稻的高产和稳产特性建立了良好的基础，同时利用分子标记辅助选择技术，将提高产量、改善品质、增强抗性的优异基因聚合到一个基因组中，就可以在较短的育种周期内培育出集高产、优质、多抗于一体的优良杂交稻亲本或品种。　　 本研究利用与直立穗型基因Ep1、广亲和性基因S5n、白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的SSR标记RM7048、GXR6和EST标记C189进行辅助选择，培育了一批单基因代换系水稻材料，同时利用单基因代换系间复交和回交，获得多基因聚合育种材料。主要结果如下：　　 1通过标记辅助回交育种，分别将Ep1、S5n、Xa23基因导入到23个受体亲本（6个不育系、5个保持系、8个恢复系、4个常规稻）中，获得分别携带EP1、S5n、Xa23单基因的BC2F1材料。　　 2将19个株系的广亲和后代与粳稻测交，测交TC1F1小穗育性在58.87％-73.69％之间，有5个株系测交TC1F1小穗育性达到广亲和标准（70％），9个株系测交TC1F1小穗育性在65％-70％之间，5个株系测交TC1F1小穗育性低于65％。　　 3对部分携带有Xa23基因的BC3F1和BC4F1代换系进行遗传背景分析。结果表明：BC3F1和BC4F1代的遗传背景回复率在各受体代换系间存在较大差异。先B为受体材料的10个BC3F1单株背景回复率平均为91.4％，最高达96.5％；9个BC4F1单株背景回复率平均为95.1％，最高达98.6％。天B为受体材料的14个BC3F1单株背景回复率平均为88.4％，最高达93.4％；8个BC4F1单株背景回复率平均为90.3％，最高达97.1％。盟B为受体材料的14个单株背景回复率平均为92.5％，最高达95.7％；10个BC4F1单株背景回复率平均为93.5％，最高达96.4％。　　 4将携带Xa23且经过背景选择的先B、天B、盟B分别与对应的不育系成对杂交和回交，获得了改良的先A、天A、盟A水稻材料。　　 5采用回交育种结合标记辅助选择的方式构建23个水稻受体亲本的多基因聚合系。其中，以盟B为受体材料，将分别含S5n和Xa23的盟B近等基因系复交和回交，获得含杂合S5n和Xa23双基因的单株5株。　　 研究结果表明，标记辅助选择是提高直立穗型、广亲和性和白叶枯病抗性育种效率的关键技术，所取得的阶段性成果为最终培育出多优良基因聚合的水稻新品种打下坚实的育种材料基础。