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目的:C-KIT基因在RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性的AML患者中的发生率为30-50%,且预后较差,往往导致较低的CR持续时间及整体生存率。对于白血病的“二次打击”学说,仅仅发生RUNX1-RUNX1T1融合基因突变是不能够直接导致白血病的还需要与第一类突变共同作用,C-KIT是第一类突变中的一个重要的突变。虽然,C-KIT被公认为RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性的AML患者的不良预后影响因素,但临床患者的预后仍存在较大的异质性。为此本研究收集了54例伴有C-KIT突变的RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性的成人AML患者初诊时的临床资料,通过对C-KIT突变功能域、C-KIT突变负荷以及除C-KIT以外其它伴随突变三个层次进行预后分析,为临床提供指导。方法:1、收集病例资料2009年7月至2019年12月在我院血液科初治的RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性并伴随C-KIT基因突变的AML患者共54例。资料从医疗记录中收集,包括年龄、性别、伴随突变、C-KIT基因突变类型等基本资料,通过对C-KIT突变功能域、C-KIT突变负荷以及除C-KIT以外其它伴随突变三个层次进行预后分析。2、治疗方案54例患者按照成人AML指南,基础的治疗方案为阿糖胞苷联合蒽环类药物(“3+7”方案),并且在发生第一次缓解后进行大剂量阿糖胞苷3~4个疗程的治疗(3 g/m2,每12 h 1次,6个剂量),部分病人联合采用地西他滨治疗。如果患者经济状况允许且有意愿将对其进行造血干细胞移植治疗。3、评估指标总生存时间(OS)定义为确诊开始至因其他原因引起死亡之间的时间(如果是失访患者我们将选择最后一次随访截止时间)。无病生存时间(DFS)是指从缓解开始至第一次肿瘤复发/转移或由于任何原因导致受试者死亡之间的时间(如果是失访患者我们将选择最后一次随访截止时间)。复发(RP)是指患者外周血或骨髓血中的原始细胞占比再次>5%或在达到第一次缓解后的任何髓外部位发生复发。完全缓解(CR)的标准参考《血液病诊断及疗效标准(第4版)》,所有治疗患者的相关白血病症状以及体征都完全同于正常人,红细胞与巨核细胞系正常,骨髓原粒细胞I型+II型/原单+幼单核细胞≦5%,无髓外白血病,外周血中性粒细胞>1.5×109/L,血小板计数>100×109/L,白细胞分类中未见白血病细胞。4、确定二代测序、Sanger一代测序确定伴随突变以及C-KIT突变类型提取患者骨髓标本DNA,通过普通PCR法进行扩增。扩增得到的产物送往北京华大基因科技服务有限公司,并进行二代测序或Sanger一代测序,测序结果的比对参照NCBI基因库序列;5、选择C-KIT-D816V/Y以及N822K突变类型的样本进行dd-PCR由测序得出C-KIT基因突变类型,选择C-KIT-D816V/Y以及N822K突变类型的样本43例进行微滴式数字PCR,探针序列见下方材料与方法,通过dd-PCR技术检测C-KIT基因突变负荷。6、将54例伴随C-KIT突变的RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性的AML患者按照功能域分为两组E17对应Tyrosine kinase 2 domain,E8、E9对应Extracellular domain,据此分为两组。7、将除C-KIT基因突变以外其它伴随突变按照功能分类将54例患者的其它伴随突变进行功能分类分为增殖、分化以及表观遗传基因三组。8、通过dd-PCR定量检测突变水平根据ROC曲线约登指数确定43例患者初诊时C-KIT基因突变负荷的界值,据此将43例患者分为C-KIT基因突变高水平组和低水平组。结果:1、将54例患者按照初诊时C-KIT突变不同功能域分为Tyrosine kinase 2domain和Extracellular domain两组,比较两组的5年生存期(OS)、5年无病生存期(DFS)以及发生第一次复发(RP1)、第一次缓解(CR1),结果均无统计学差异;2、将其它54患者其它伴随突变按照功能分类,显示表观遗传类基因组5年OS:P=0.040,5年DFS:P=0.010,即初诊时发生伴表观遗传类基因突变的患者预后较差;3、对54例患者初诊时的其它伴随突变进行统计学分析发现伴随ASXL1突变对其预后有统计学意义(5年OS:P<0.001;5年DFS:P<0.001),即初诊时伴随ASXL1突变是伴有C-KIT基因突变的RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性的AML患者预后差生存期短的不良影响因素;4、将54患者中的43例AML患者初诊时的骨髓DNA样本进行dd-PCR,其C-KIT基因突变结果根据ROC曲线约登指数确定临界值(49.39%)分为高低水平两组,比较两组的5年OS、5年DFS以及RP1,结果均有统计学意义(OS:P=0.005;DFS:P=0.006;RP1:P=0.023),即初诊时C-KIT基因突变负荷是RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性的AML患者预后的不良影响因素,高水平患者生存期短且易发生复发;5、将C-KIT突变功能域、除C-KIT以外其它伴随突变功能分类以及C-KIT突变负荷分别分析其组间临床特征,结果表明表观遗传基因组以及增殖组相对于分化组骨髓原始细胞比例低(P表观VS分化=0.023;P增殖VS分化=0.008)。结论:1、对于伴有C-KIT基因突变的RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性成人AML患者,初诊时C-KIT基因突变负荷对患者总生存及临床复发有显著影响,可为临床评估预后、及时调整治疗方案有重大意义。以及,其伴随ASXL1突变或表观遗传基因类突变可能有更差的预后。2、将除C-KIT以外其他伴随突变按照功能分类,表观遗传基因组以及增殖组相对于分化组骨髓原始细胞比例低。