鲜花源肠球菌耐药情况调查及optrA基因分子传播特征

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zj280078064
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近年来,细菌耐药性问题已成为全球关注的公共卫生安全问题。鲜花与人类生活密切相关,然而,目前关于鲜花源细菌耐药情况的调查十分缺乏,鲜花是否会成为临床重要耐药菌/耐药基因的媒介仍不清楚。因此,本次实验以鲜花为研究对象,采集鲜花种植基地、花卉市场、医院附近的花店中鲜花样品,调查不同采样点鲜花源肠球菌的耐药情况,并进一步探究鲜花源肠球菌中质粒介导的利奈唑胺耐药基因optr A的流行特征与分子传播机制,以期为评估鲜花是否会成为携带重要耐药菌/耐药基因的潜在危险因子提供基础数据,也为控制耐药性传播提供新思路。本研究采集三个不同采样点鲜花样品共974份,分离肠球菌223株,分离率为22.9%,共分离到5种不同菌种的肠球菌,其中,粪肠球菌分离率最高(56.1%,125/223),其次是屎肠球菌(23.8%,53/223)和蒙氏肠球菌(17.9%,40/223)。肠球菌在种植基地分离率最高(35.9%),花卉市场次之(21.9%),医院附近花店最低(4.2%),但是不同菌种的肠球菌在不同采样点中分离率基本无差异。采用琼脂稀释法对223株肠球菌进行药物敏感性试验。结果显示,肠球菌对克林霉素、环丙沙星及杆菌肽等多种受试抗菌药物耐药率达将近50%或以上,对氟苯尼考及利福平耐药率相对较低,分别为14.7%和25.6%,对利奈唑胺耐药水平最低,为4.3%(n=9)。分析不同采样点来源的肠球菌耐药情况,发现除四环素和阿奇霉素外,整体上呈现花店来源菌株的耐药率最高、种植基地次之、花卉市场最低的趋势。分析不同菌种的肠球菌耐药情况,发现粪肠球菌和屎肠球菌对除氟苯尼考外的其它抗菌药物的耐药率均高于其它菌种肠球菌包括蒙氏肠球菌。采用PCR方法检测223株肠球菌中常见耐药基因,发现erm(B),tet(L),tet(M)的检出率较高,均达到45.0%以上,其次是bcr B(29.2%)和erm(A)(18.4%),接着是optr A,fex A和aph(3")-IIIa检出率均接近14.0%(n=31),其它耐药基因均低于11.0%,未检测到cfr,cfr B,cfr C及poxt A等重要耐药基因。各类耐药基因在不同采样点之间检出率整体呈现基本相同的流行趋势,即花店样品中检出率最高,种植基地次之,而花卉市场样品检出率最低。此外,发现erm(B),bcr B,氨基糖苷类以及四环素类耐药基因的检出率在粪肠球菌和屎肠球菌中均高于其它菌种肠球菌(包括蒙氏肠球菌),然而,optr A、fex A以及erm(A),检出率则相反,在其它菌种肠球菌中较高。31株optr A阳性肠球菌,仅有9株对利奈唑胺耐药,但均呈现为多重耐药表型,且携带多个耐药基因,其中最常见的耐药基因组合为erm(B)-erm(A)-fex A-tet(L)-tet(M)-aph(3")IIIa-ant(6’)-Ia-bcr B(n=9)和erm(B)-fex A-tet(L)-tet(M)-aph(3")IIIa-ant(6’)-Ia-bcr B(n=8),此外,还发现多个耐药基因包括fex A、erm(B)、erm(A)及bcr B等在optr A阳性菌株中携带率明显高于optr A阴性菌株。进一步对阳性菌中optr A基因突变位点进行检测,共发现四种突变类型,其中菌株中optr A基因发生RDK突变多表现对利奈唑胺耐药。采用PFGE和MLST方法分析31株optr A阳性肠球菌的亲缘关系,22株粪肠球菌共分为8个PFGE谱型及7个ST型,其中ST202(n=6)、ST376(n=6)型为优势ST型,且在同一或不同采样点之间均存在克隆传播。9株蒙氏肠球菌分为三个群系,均来自同一种植地,存在局部克隆传播。基因定位显示6株optr A阳性粪肠球菌中optr A基因位于质粒上,主要大小为70 kb,其中一株携带optr A质粒可发生接合转移,并且介导利奈唑胺耐药;其余25株optr A阳性肠球菌中optr A基因均位于染色体上。进一步根据PFGE及MLST谱型特征,挑选13株optr A阳性菌株进行二代测序,获得5种不同类型的optr A基因环境。在蒙氏肠球菌中,发现两种类型位于染色体上的optr A基因环境,分别为HAD-Tn558-ara C-optr A-Csp(n=2)和HAD-Tn558-ara Coptr A-erm(A)-Csp(n=1)。然而,在粪肠球菌中,发现两种类型位于染色体上的和一种类型位于质粒上的optr A基因环境,依次为HAD-Tn554-fex A-optr A-Csp(n=7),fex Aoptr A(n=1)和IS1216E-fex A-optr A-ISEnfa1(n=2)。进一步分析发现,除一株外,其它蒙氏和粪肠球菌染色体上携带optr A基因的序列片段均插入在肠球菌染色体上编码DNA修复蛋白功能的rad C基因上,其插入位点及方式与Tn554家族介导的转座相似,暗示肠球菌染色体捕获optr A可能与Tn554,Tn558有关。综上所述,鲜花中肠球菌存在较高的分离率,菌株耐药情况较为严重,尤其是optr A基因存在一定的流行性,尽管仅部分菌株介导利奈唑胺耐药,但阳性菌株常携带多个常见耐药基因,均呈现多重耐药的表型。optr A基因的散播与菌株的克隆传播、Tn554及Tn558等介导的转座相关。因而,我们应当重视鲜花中耐药菌/耐药基因的污染,避免其成为重要耐药基因传播媒介,危害公众健康。
其他文献
作为一种典型的非财报信息,战略合作信息具有独特的价值,正受到资本市场越来越多的关注。以2007—2018年上市公司战略合作协议公告作为研究对象,采用人工评分法和文本分析法全面评价了战略合作信息披露质量,并探讨了信息披露质量、信息披露"言行一致"的"短期"市场反应及其对经营业绩的影响。研究发现,资本市场对战略合作信息披露持积极反应,即战略合作信息披露质量越高,信息披露窗口期股票超额累计收益率越高。同
猪圆环病毒3型(Porcine Circovirus Type 3,PCV3)是一种新的猪圆环病毒,于2016年在美国猪群中首次发现该病毒。随后,在亚洲、欧洲和美洲的多个国家报道了PCV3单独或混合感染的病例。PCV3与母猪繁殖障碍、呼吸系统疾病、多系统炎症以及仔猪先天性震颤等临床疾病相关。自2017年以来,我国多个省市及地区均检测到PCV3的存在,呈现广泛的分布及流行,对我国养猪业存在潜在威胁,
细菌对头孢菌素类抗生素耐药的最主要原因是产生了超广谱β-内酰胺酶(extended spectrumβ-lactamases,ESBLs),该酶可以水解β-内酰胺类抗生素。抗生素的不合理使用,加快了CTX-M型ESBLs的形成与传播。近年来,CTX-M-55已经成为了亚洲人类、动物以及环境中检测到的新兴ESBLs类型。本论文调查了我国广东省不同地区的食品动物源的沙门菌中CTX-M-55型超广谱β-
猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是世界养猪行业中最具经济破坏性的疾病之一,它于1980年同时出现在北美和欧洲,其元凶是猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV),一条折叠的单股正链RNA病毒,归属于动脉炎病毒科动
副猪嗜血杆菌病作为高死亡率的猪呼吸道传染病,常引起多发性纤维素性浆膜炎和关节炎,又称格拉泽氏病,给养猪业造成重大经济损失。同时,由于副猪嗜血杆菌血清型多达15种,且具有明显的地域差异,疫苗免疫交叉保护率低。因此,抗生素治疗仍然是目前有效控制副猪嗜血杆菌感染的重要手段。加米霉素是治疗家畜呼吸系统疾病的新型大环内酯类药物,而其对副猪嗜血杆菌的药动/药效(PK/PD)关系研究,目前未见报道。本研究在阐明
裳蛾亚科Erebinae隶属于鳞翅目Lepidoptera夜蛾总科Noctuoidea裳蛾科Erebidae,全世界约有10000种,是裳蛾科中种类最多的类群之一,分布于全世界,而中国华南和西南地区地跨东洋区和古北区,植被种类丰富多样,裳蛾亚科种类繁多,研究该地区裳蛾亚科分类具有重要的参考价值和现实意义。本文记述了裳蛾亚科的研究概况,简要介绍了研究材料与方法,描述了成虫外部形态特征、生殖器特征及翅
革兰氏阴性菌对抗生素的耐药性越来越严重,当前黏菌素是对抗革兰氏阴性菌感染的“最后一道防线”。随着黏菌素的不合理使用,细菌耐药率不断升高,使黏菌素逐渐失去治疗作用。而革兰氏阴性菌复杂的膜结构加大了研发新药的难度。将已有的抗生素或非抗生素联合使用是对抗细菌感染有效、快捷的方式。我们发现,异丙氧苯胍与黏菌素联合使用对黏菌素耐药的大肠杆菌有抑菌增效作用,本论文旨在探究这种抑菌增效作用是否对其它革兰氏阴性菌
猪葡萄球菌(Staphylococcus hyicus,S.hyicus)是猪渗出性皮炎(exudative epidermitis,EE)的病原,可以引发仔猪皮肤脱落甚至脱水死亡。该病一直影响着全球养猪业的发展,目前对于猪渗出性皮炎在中国的流行情况以及血清型的研究尚不清楚,对该病的感染也缺乏有效的防治措施。本研究对猪渗出性皮炎的流行病学、致病性、诊断方法及灭活疫苗进行了研究,以期为我国渗出性皮炎
金霉素是一种四环素类广谱抗生素,对革兰阳性菌、阴性菌、立克次氏体和大型病毒都有广泛的抑制能力。在日常饲料中添加金霉素,可有效防治细菌性肠炎和肺炎等,还能有效提高畜禽日增重和饲料转化效率。本研究进行了金霉素微囊和金霉素预混剂在模拟绵羊的体外释放度和对绵羊瘤胃细菌菌群多样性影响的研究。通过体外释放研究筛选金霉素微囊的最合适处方,并进行了瘤胃细菌多样性的影响研究来展开验证,为进一步研发金霉素微囊提供科学
氟苯尼考是动物专用的酰胺醇类抗生素,具有广谱、高效和抗菌活性强等特点,多种革兰氏阳性菌和阴性菌都对其敏感,在水产养殖、畜牧养殖中已得到广泛应用。市售的氟苯尼考剂型种类较多,常见的有氟苯尼考粉、预混剂、溶液剂以及注射液等剂型。氟苯尼考预混剂内服后在动物机体中吸收迅速,达峰时间快,峰浓度高,有效血药浓度的维持时间较短,为了达到治疗效果,在临床使用中需要多次给药。本论文以课题组研制的氟苯尼考微囊化颗粒为