我国已经通过立法方式明确了行政公益诉讼制度,并赋予检察机关启动行政公益诉讼的主体地位,至此,法学界对于行政公益诉讼原告资格问题的争论暂时平息,但在受案范围、举证责任、诉前程序等方面仍然有待探讨与完善。在司法实践中举证责任分配问题尤为重要,不仅与案情认定密切相关,对案件最终判决结果产生影响,而且直接关系到行政公益诉讼制度的成效。由于与普通的行政诉讼相比,行政公益诉讼具有的一定的特殊性,因而行政公益诉讼举证责任分配也需要重新审视,而不能直接套用一般的规则。本文针对行政公益诉讼举证责任分配进行研究,内容分为四部分。第一部分是行政公益诉讼举证责任分配的理论分析。首先,介绍行政公益诉讼的特殊性及行政公益诉讼的特殊性对举证责任分配的影响;其次,介绍行政公益诉讼举证责任分配观点及其分析;最后,分析行政公益诉讼举证责任分配与民事公益诉讼举证责任分配的区别。第二部分是我国行政公益诉讼举证责任分配的现状及问题。首先,介绍我国行政公益诉讼举证责任分配的立法现状,包括立法未规定检察机关“公益诉讼起诉人”的举证责任及被告行政机关适用原来举证责任法律规定;其次,通过案例介绍我国现阶段司法实践中行政公益诉讼举证责任分配的现状;最后,分析我国行政公益诉讼举证责任分配的问题,主要包括未对举证责任分配进行作为和不作为类区分和缺少公益侵害构成要件举证责任分配的明确规定。第三部分主要论述完善我国行政公益诉讼举证责任分配制度的必要性,包括诉讼当事人地位不平等发生了变化、证明对象不同、诉讼程序的差异、行政诉讼目的需要以及举证能力发生了变化,因此需要我们对其进行完善。第四部分是对我国行政公益诉讼举证分配制度的完善,包括明确行政公益诉讼举证责任分配的相关法律规定、优化行政公益诉讼举证责任分配规则、对公益侵害构成要件举证责任分配进行具体规定及强化行政公益诉讼举证责任分配制度的配套措施。