【摘 要】
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黄河鲤（Cyprinus carpio haematopterus Temminck et Schlegel）是我国黄河流域重要的养殖鱼类,因其具有生长速度快、抗逆性强、口味鲜美等优势而深受广大养殖户及消费者的喜爱。然而,在过去的几十年里,随着黄河鲤养殖产业的快速发展,黄河鲤生长、抗逆等性状不断下降,因此亟需选育高产抗逆新品种以促进黄河鲤产业的健康可持续发展。本研究通过建立黄河鲤家系,并在其体长1
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黄河鲤（Cyprinus carpio haematopterus Temminck et Schlegel）是我国黄河流域重要的养殖鱼类,因其具有生长速度快、抗逆性强、口味鲜美等优势而深受广大养殖户及消费者的喜爱。然而,在过去的几十年里,随着黄河鲤养殖产业的快速发展,黄河鲤生长、抗逆等性状不断下降,因此亟需选育高产抗逆新品种以促进黄河鲤产业的健康可持续发展。本研究通过建立黄河鲤家系,并在其体长10cm左右的时候腹腔注射PIT标记,分别在4月龄、9月龄、13月龄和17月龄时测量家系的体质量、体长、体高及体厚,17月龄测量之后剪取鳍条通过Super-GBS技术对黄河鲤进行了遗传连锁图谱构建和生长性状的条件和非条件QTL定位。主要研究结果如下:（1）黄河鲤遗传连锁图谱的构建:本研究利用Joinmap5软件构建了黄河鲤的高密度遗传图谱,通过筛选和过滤后,共有10286个SNP标记用于构建黄河鲤遗传图谱。其中黄河鲤整合图谱包含50个连锁群,图谱总长为3474.01 c M,标记平均间距为0.35c M,标记间距从0.19 c M到0.62 c M不等,连锁群平均长度为69.48 c M,连锁群的长度从52.10 c M到133.70 c M不等。雌雄遗传图谱也有很高的标记密度。雌性遗传图谱由6702个标记组成,图谱总长为3003.984 c M,标记平均间距为0.49 c M,标记间距从0.20c M到0.83 c M不等,连锁群平均长度为60 c M,连锁群的长度从45.81 c M到136.97 c M不等。雄性遗传图谱由5478个SNP标记组成,图谱总长为2899.883 c M,标记平均间距为0.56 c M,标记平均间距从0.25 c M到0.95 c M不等,连锁群平均长度为57.99 c M,连锁群长度从34.99 c M到79.87c M不等。（2）黄河鲤体质量相关QTL定位及分析。在4月龄、13月龄和17月龄内共检测到116个非条件QTL并分布于不同的连锁群,有4个非条件QTL在3个时期同时被检测到,可解释表型变异率介于0.20～4.64%之间,27个非条件QTL分别在2个时期被检测到,其可解释表型变异率介于0.01～48.92%之间,其余85个非条件QTL仅在单个时期被检测到;共检测到103个与体质量相关的条件QTL,其中7个位点在3个时期均可被检测到,其可解释表型变异率介于0.02～50.29%之间,有29个条件QTL在2个时期同时被检测到,其他67个位点只在某个时期被检测到,其可解释表型变异率介于0.01～87.48%之间。（3）黄河鲤体长相关QTL定位及分析。在3个不同的测量时期内共检测到45个非条件QTL,有4个非条件QTL同时在3个时期均被检测到且都在第39连锁群上,其可解释表型变异率介于6.74～10.29%;其余42个非条件QTL分别在1或2个时期检测到;共检测到174个影响体长的条件QTL,其中2个位点在3个时段内检测到,其可解释表型变异率仅为1.01～9.21%,其余172个条件QTL分别在1或2个时期检测到,其可解释表型变异率介于0.01～96.4%。（4）黄河鲤体高相关QTL定位及分析。在3个不同的测量时期内共检测到149个非条件QTL,有2个非条件QTL同时在2个时期均被检测到,可解释表型变异率最高为11.84%;其余147个非条件QTL分别在1个时期检测到,其可解释表型变异率介于0.01～94.63%之间;共检测到171个影响体高的条件QTL,其中1个条件QTL在3个时段内检测到,其可解释表型变异率仅为0.46%,其余170个条件QTL分别在1或2个时期检测到,其可解释表型变异率介于0.01～81.16%之间。（5）黄河鲤体厚相关QTL定位及分析。在3个不同的测量时期内共检测到46个非条件QTL,仅有3个非条件QTL同时在2个时期均被检测到,可解释表型变异率4.72～9.03%;其余43个非条件QTL分别在1个时期检测到;共检测到41个影响体厚的条件QTL,仅有1个条件QTL在2个个时段内检测到,其可解释表型变异率仅介于0.67%～1.45%之间,其余400个条件QTL均在1个时期检测到,其可解释表型变异率最高为79.42%。本研究最终构建了一个包含50个连锁群和10286个SNP标记的黄河鲤高密度遗传连锁图谱。共定位了708个条件和非条件QTLs,其中体质量、体长、体高和体厚相关QTLs位点分别为152个、193个、280个和83个。研究发现影响不同时期黄河鲤生长的QTL差别较大,有些位点同时存在于多个时期,有些位点只存在于某个时期,研究结果有助于进一步解析黄河鲤的生长发育机制并为黄河鲤生长性状的分子标记辅助育种提供依据。
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