Circ-HOMER1/miR-513a-3p/KRAS轴在结直肠癌中的分子作用机制

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tb0401292
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:目前,多项研究发现具有闭合环形结构的环状RNA(circRNA)作为一种内源性非编码RNA(ncRNA)参与着肝癌、鼻咽癌、肺癌及食管癌等多种肿瘤的发生发展过程。ZHAO等人研究发现circ-HOMER1参与肝癌的发生发展,其在肝癌细胞高表达,通过调控下游作用位点miR-1322及CXCL6促进肝癌细胞增殖、侵袭及迁移[1]。Circ-HOMER1在结直肠癌中尚无相关报道,我们课题组前期研究发现circ-HOMER1在结直肠癌组织较癌旁组织中表达水平升高。故针对消化系统高发肿瘤结直肠癌,本课题组设计了一系列实验,旨在探索circ-HOMER1在结直肠癌(CRC)组织和细胞系中的分子调控机制。方法:1、qRT-PCR(Quantitative real-time-polymerase chain reaction)技术检测16对肿瘤组织及癌旁组织标本中circ-HOMER1的表达水平。2、使用X~2检验分析CRC患者的临床特征(癌细胞分化程度、淋巴结转移情况、癌组织浸润肠壁深度、癌症的TNM分期、患者的性别以及年龄)与circ-HOMER1表达水平两者之间的关系(P<0.05时差异有统计学意义)。3、在正常肠上皮细胞系NCM460以及结直肠癌细胞系DLD1、SW620中,通过qRT-PCR技术检测circ-HOMER1的表达水平,发现在DLD1细胞系中,circ-HOMER1差异表达最显著,故选择DLD1细胞系进行下一步实验。4、根据circ-HOMER1序列设计si RNA及其对照,在DLD1细胞系中进行细胞转染及细胞功能学实验。采用CCK-8、克隆形成实验、Transwell及划痕实验分别检测细胞的增殖能力、克隆活性、侵袭力及转移能力。5、circ-HOMER1的下游作用位点使用生物信息学方法预测,结果为miR-513a-3p及KRAS。在成功转染circ-HOMER1 si RNA的DLD1细胞系中测定miR-513a-3p表达水平的变化,KRAS的表达水平的测定包括m RNA和蛋白两个方面。6、根据circ-HOMER1及KRAS序列与miR-513a-3p互补配对的区域,设计合成野生型及突变型双荧光素酶报告载体质粒,并使用双荧光素酶报告实验验证circ-HOMER1与miR-513a-3p,miR-513a-3p与KRAS的靶向结合作用。7、使用SPSS Statistics 26.0及Graphpad8.0软件对结果进行统计分析处理并作图。两组定量资料的比较应用t检验,以比较所分析参数的平均值。应用单因素方差分析比较多组正态分布数据间组间差异。通过卡方检验分析circ-HOMER1表达水平与CRC临床特征的关系。用平均值±标准差(mean±SD)表示分析所得结果(当P<0.05时认为差异具有统计学意义)。结果:1、CRC组织及细胞系中circ-HOMER1高表达16对临床标本qRT-PCR结果显示:结直肠癌组织中circ-HOMER1较其配对的癌旁组织表达上调。结直肠癌细胞系DLD1、SW620中circ-HOMER1的表达含量较正常肠上皮细胞系NCM460显著升高(P<0.05),且DLD1细胞系的差异表达最显著。ROC曲线评估circ-HOMER1表达在区分CRC与正常组织中的预测能力,结果显示ROC曲线下面积(AUC)为0.7539,其中95%置信区间为0.5816–0.9263(P=0.0143)。以上结果证实了circ-HOMER1在CRC肿瘤组织中高表达,提示circ-HOMER1可能作为CRC潜在的诊断标志物。2、CRC患者中,circ-HOMER1的表达与以下临床特征无关X~2检验分析发现circ-HOMER1的表达与CRC患者的临床特征(癌细胞分化程度、淋巴结转移情况、癌组织浸润肠壁深度、癌症的TNM分期、患者的性别以及年龄)无关(P>0.05)。3、降低circ-HOMER1的表达水平能抑制CRC细胞在增殖,侵袭和迁移方面的能力成功设计了两个特定的干扰序列(si RNA-1和si RNA-2)来阻断DLD1细胞系中circ-HOMER1的表达。CCK-8、克隆形成实验及、Transwell及划痕实验结果表明,降低circ-HOMER1的表达水平能抑制CRC细胞在增殖,侵袭及迁移方面的能力。4、miR-513a-3p及KRAS是circ-HOMER1的下游作用位点生物信息学方法预测到circ-HOMER1的下游作用位点是miR-513a-3p,miR-513a-3p的下游靶基因是KRAS。在敲低circ-HOMER1的DLD1细胞系中,qRT-PCR检测miR-513a-3p的表达,KRAS的表达使用qRT-PCR和Western blotting检测。结果显示miR-513a-3p表达水平显著上调,KRAS在m RNA和蛋白水平上的相对表达水平均显著下调。5、CRC细胞系中的circ-HOMER1/miR-513a-3p/KRAS轴生物信息学分析软件构建出circ-HOMER1/miR-513a-3p/KRAS调控轴,根据circ-HOMER1及KRAS序列与miR-513a-3p互补配对的区域,设计合成野生型及突变型双荧光素酶报告载体质粒,circ-HOMER1与miR-513a-3p,miR-513a-3p与KRAS的靶向结合作用使用双荧光素酶报告实验进行验证。综上我们证实了circ-HOMER1可通过circ HOMER1/miR-30a-5p/KRAS轴增强结直肠癌细胞的增殖能力、侵袭能力及转移能力。Circ-HOMER1有望成为诊断和治疗CRC的标志物和重要靶标,也为详细阐明结直肠癌的分子机制提供了理论和实验依据。结论:1、CRC组织及细胞系中circ-HOMER1高表达,并且circ-HOMER1可能作为CRC诊断的潜在标志物。2、X~2检验分析发现circ-HOMER1的表达与CRC患者的临床特征(癌细胞分化程度、淋巴结转移情况、癌组织浸润肠壁深度、癌症的TNM分期、患者的性别以及年龄)无关(P>0.05)。3、体外细胞功能实验证实了circ-HOMER1可作为致癌因子促进肠癌细胞的增殖及侵袭。4、从机制上阐述了circ-HOMER1可通过circ-HOMER1/miR-513a-3p/KRAS轴调节结直肠癌增殖及侵袭。
其他文献
国卫人发[2021]8号委机关各司局,委直属和联系单位,国家中医药局,中国老龄协会:《国家心理健康和精神卫生防治中心主要职责、内设机构和人员编制规定》已经委党组会议研究通过,现予印发。2021年2月2日国家心理健康和精神卫生防治中心主要职责、内设机构和人员编制规定
期刊
喷射混凝土作为初期支护的重要组成部分在水电站大跨径地下洞室中对保证围岩稳定和施工安全的作用尤为明显。介绍了巴塘水电站导流洞工程湿喷混凝土配合比的设计情况,提出了湿喷混凝土配合比配制强度必须考虑速凝剂抗压强度比的损失量的观点,根据现场喷混凝土试验的回弹率确定砂率、验证喷混凝土的力学性能,设计出满足施工需求、经济效益最大化的湿喷混凝土配合比。
近年来,黑龙江省农产品逐渐被引入到新媒体网络直播带货中,但在总体直播带货的商品中农产品所占比例较低。因此,本文主要以抖音平台上的农产品直播带货为主体,通过访谈和调研,得出黑龙江省农产品利用抖音直播带货平台进行营销的相关策略。
生猪产业作为我国农业经济的重要组成部分,其呈现农户散养为主,集约化、规模化养殖程度不断提升的格局,随着近年来我国生猪产业环保政策日趋严谨,生猪产业面临转型升级等局势,使得我国生猪产业迎来高质量发展阶段。生猪作为生物性资产,极易受外部因素影响,而且生猪价格具有周期波动趋势,会对企业生产销售产生一定影响,抗市场风险弱的企业极易退出市场。盈利质量作为评价一家公司能否持久性经营的关键,研究生猪企业的盈利质
经济增速放缓、中美贸易摩擦增加不确定性和2020年不期而来的“新冠疫情”三大背景交织叠加,给我国经济环境和企业生产经营活动带来巨大持久的影响,我国各类企业财务管理面临挑战和机遇。我们进入了后疫情时代,后疫情时代可以分为疫情爆发期、恢复生产期、正常回归期和博弈重塑期四个阶段,每一个阶段企业的财务管理都有鲜明的特征。本文以后疫情时代企业的经济环境为起点,按照“环境分析→企业战略→企业目标→财务活动→应
人的整体素质包括生理素质、心理素质和社会文化素质。素质教育的核心是心理素质的教育,心理教育是实施素质教育的前提。本文基于此,针对心理卫生教育对高职护生心理健康状态的影响与教育对策进行分析。
电学实验一直是历年高考的必考考点,也是高中教学的重点和难点,学生在学习过程中,困难较大。下面以定值电阻为切入点,结合教学实例,谈谈定值电阻在设计电路中的巧妙运用。一、伏安法测电阻中定值电阻的使用1.定值电阻保护电路减少误差例1需要测量待测电阻Rx的阻值(约30Ω),
期刊
目的:分析放疗后局部复发宫颈癌患者行组织间插植放疗的疗效、预后因素及毒性反应。方法:纳入2016年10月至2020年8月期间收治的放疗后局部复发且排除远处转移的宫颈癌患者,所有患者均行组织间插植放疗,单次处方剂量6-7Gy,1-2次/周,共1-7次。假设肿瘤组织α/β值为10,根据线性二次方程(LQ)进行肿瘤等效生物剂量(EQD2)的计算,所有患者插植放疗的中位EQD2为40.93Gy(范围:9.