重要工业生产菌株恶臭假单胞菌是革兰氏阴性菌,其细胞表层分布大量脂多糖分子,对细胞的生长和代谢调控起着重要作用;但这些脂多糖分子的精细结构目前未见报道。本论文利用生物化学、分析化学和分子生物学技术,对恶臭假单胞菌KT2442细胞表层类脂A分子结构多样性进行了研究,并鉴定了相关基因功能。主要研究结论如下:（1）从恶臭假单胞菌KT2442细胞膜中提取纯化脂质分子,并通过TLC、HPLC和ESI/MS/MS分析,确定了恶臭假单胞菌KT2442细胞膜中的磷脂组分和类脂A结构。磷脂中磷脂酰乙醇胺、磷脂酰甘油、心磷脂的含量分别为79.9%、12.7%和7.4%;磷脂脂肪酸链组成主要为C16:1和C18:1。恶臭假单胞菌KT2442中至少存在六种不同的类脂A分子结构,脂肪酸链组成主要为C₁₀和C₁₂。（2）鉴定了KT2442染色体上的基因PP₀737和PP₃154均编码类脂A的脱酰基化酶,能够去除类脂A分子3位上的脂肪酸链,因而将这两个基因分别命名为pag L1和pag L2。首先通过在大肠杆菌W3110和HW001中进行异源表达,初步鉴定这两个基因均能编码脱酰基化酶;接着在KT2442中构建pag L1和pag L2的单敲除和双敲除突变株,进一步确定了这两个基因在KT2442中能够编码脱酰基化酶;最后在双敲除突变株中进行了这两个基因的回补表达,验证这两个基因都能编码脱酰基化酶。（3）系统研究了不同培养环境对pagL1和pagL2转录及类脂A脱酰基化的影响。将KT2442在不同温度、二甲苯浓度、锌离子浓度、镁离子浓度、p H条件下进行培养。pag L1的转录水平在高浓度锌离子和高浓度的镁离子条件下发生下调;pag L2的转录水平在高浓度二甲苯、高浓度锌离子、低浓度的镁离子条件下发生了上调;另外温度和锌离子主要影响了Pag L1和Pag L2的酶活。脱酰基化水平随着温度和二甲苯浓度的升高而升高,随着锌离子浓度和镁离子浓度的升高而降低。（4）系统研究了Pho P-Pho Q和ColR-ColS双组份调控系统在不同环境条件下对pagL1和pag L2的影响。将两个调控系统的敲除突变株在不同二甲苯浓度、锌离子浓度和镁离子浓度条件下进行培养。Pho P-Pho Q在高镁和低镁条件下均上调类脂A的脱酰基化水平;Col R-Col S在LB条件和高镁离子条件下轻微下调了脱酰基化水平;Col R-Col S在二甲苯存在时上调了脱酰基化酶的整体水平;在低镁离子条件下,Col R-Col S对于类脂A脱酰基化调控规律不定。（5）初步研究发现恶臭假单胞菌KT2442染色体上的基因PP₂423和PP₄570能编码类脂A的双加氧酶,该酶能够在2位次级脂肪酸链上添加一个3-OH,因而将这两个基因命名为lpx O1和lpx O2。PP₁735能够编码类脂A的脂肪酸转移酶,能够在2’位上添加一条C₁₂的次级脂肪酸链,因而将这个基因命名为lpx L2;初步鉴定PP₀024能够编码类脂A的磷酸乙醇胺转移酶,能在1或者4’位的磷酸基团上添加磷酸乙醇胺,因而将这个基因命名为eptA。