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长链脂肪酸如同信号分子一样,也是重要的代谢产物。研究发现在长链脂肪酸摄取中一些候选蛋白如脂肪酸易位酶(FAT/CD36),脂肪酸合成蛋白(FABP),长链脂肪酰基辅酶A合成酶(ACSL)和脂肪酸转运蛋白(FATP)对长链脂肪酸的摄取和代谢具有重要作用,但都不如FATP对脂质代谢和脂肪相关疾病的影响,为此,当前对FATP基因家族的研究也逐渐成为了热点。本研究以四川山地乌骨鸡为试验材料,通过生物信息学分析,获取四川山地乌骨鸡FATP4蛋白的部分序列,以pMD-18T为载体,在DH5α菌株中进行FATP4蛋白CDS区的分子克隆,并对其质粒进行了序列测定。运用蛋白质组学分析工具,对CDS区的基本性质、糖基化位点、磷酸化位点、二级结构等进行了预测,确定该序列具有FATP家族的结构特点,是鸡FATP家族成员蛋白。本研究以地方品种四川山地乌骨鸡和培育优质鸡“大恒”S01系为试验材料,采用SYBR greenⅠ定量PCR分析FATP1基因和FATP4基因在10周龄这个时间点两品种间的表达差异,同时分析了四川山地乌骨鸡0周龄,2周龄,4周龄,6周龄,8周龄,10周龄和12周龄等这7个时间点FATP1和FATP4基因表达的组织差异,以及在胸肌,腿肌,心脏,肝脏等组织中FATP1和FATP4基因表达量的发育性变化。结果表明:FATP1和FATP4在两个品种间的表达差异不显著(P＞0.05)。FATP1和FATP4在不同阶段各有优势表达组织,同一组织中也有表达的优势时间点。本研究运用PCR-SSCP及测序技术检测突变位点。根据FATP1基因组序列共设计10对引物,在8个大恒优质肉鸡群体中,只有4对引物检测到多态,共检测到5处突变,分别为49360bp(SNP1,G/A),48195 bp(SNP2,G/A),46847bp(SNP3,A/G),46818bp(SNP4,A/G)和46555bp(SNP5,A/G)。检测到的突变分别位于外显子3、内含子5、内含子7、内含子7和外显子8内。由于SNP4变异位点的个体数少,为此我们没有对该位点进行后续的分析。FATP1基因突变位点与屠宰性状关联分析结果显示:SNP1位点:在70d鸡群中,GG型个体的胸肌重,腿肌重和胸肌率均显著高于AA和AG型个体(P＜0.05);在91d鸡群中,AG型个体的活重,屠体重,半净膛重,全净膛重,腿肌重和腿肌率显著高于GG型个体(P＜0.05);在所有鸡群中,AA基因型个体的活重,屠体重,半净膛重和全净膛重显著高于AG和GG型个体(P＜0.05),GG型个体的胸肌率显著高于AA和AG型个体(P＜0.05)。SNP2位点:在70d鸡群中,NN型个体的胸肌重,腿肌重,胸肌率和腿肌率显著高于MM和MN型个体(P＜0.05);在91d鸡群中,NN型个体的活重,屠体重,半净膛重和全净膛重显著高于MM和MN型个体(P＜0.05),而MN型个体的皮脂厚和腹脂率显著高于NN型个体(P＜0.05);在所有鸡群中,NN型个体的活重,屠体重,半净膛重,全净膛重,腿肌重,胸肌率和腿肌率显著高于MM和MN型个体(P＜0.05)。SNP3位点:在70d和91d鸡群中,3种基因型个体与所有屠体性状之间都没有显著差异(P＞0.05);在所有鸡群中,AA型个体的活重和屠体重显著高于AG型个体(P＜0.05)。SNP5位点:在70d鸡群中,MN型个体的活重,屠体重和全净膛重显著高于MM型个体(P＜0.05),而NN型个体的腿肌率显著高于MN型个体(P＜0.05);在91d鸡群中,NN型个体的活重,屠体重,半净膛重,全净膛重和腿肌率显著高于MM和MN型个体(P＜0.05),同时MN型个体的胸肌率显著高于NN型个体(P＜0.05);在所有鸡群中,NN型个体的腿肌率显著高于MN和NN型个体(P＜0.05)。单倍型与8个群体的屠宰性状关联分析结果显示:在70d鸡群中,单倍型组合对活重,屠体重,全净膛重,胸肌重,腿肌重,皮脂厚,胸肌率和腿肌率的遗传效应达到显著水平(P＜0.05);在91d鸡群中,单倍型组合对活重,屠体重,全净膛重,半净膛重,皮脂厚,腿肌率和腹脂率的遗传效应达到显著水平(P＜0.05);在所有鸡群中,单倍型组合对活重,屠体重,全净膛重,半净膛重,皮脂厚,腿肌率和胸肌率的遗传效应达到显著水平(P＜0.05)。同样运用PCR-SSCP及测序技术检测突变位点,根据FATP4基因组序列共设计15对引物,在8个鸡群中,有6对引物检测到多态,共检测到8处突变,分别为5108778bp(G/A),5108695(G/A),5108287(C/-),5107545(T/C),5106740(C/T),5106005(A/G),5105481(G/A)和5105454(C/T)。在FATP4基因的8个突变中,等位基因A、C、C和A依次为SNP2,SNP3,SNP5和SNP7的优势等位基因。FATP4基因单突变位点与屠体性状关联分析结果显示,SNP1位点(G5108778A):在70d鸡群中,3种不同基因型与胸肌率和腿肌率显著相关(P＜0.05);在90d鸡群中,SNP1对胸肌率和腹脂率的遗传效应达到显著水平(P＜0.05);在所有鸡群中,3种基因型与活重,屠体重,半净膛重,全净膛重,腹脂重,胸肌率,腿肌率和皮脂厚显著相关(P＜0.05)。SNP2位点(G5108695A):在70d和91d鸡群中,3种基因型与所有屠体性状都没有达到显著相关水平(P＞0.05),在所有鸡群中,GG型个体的腹脂重和皮脂厚显著高于AG型个体(P＜0.05)。SNP3位点(C5108287-):在70d鸡群中,SNP3对腹脂重,腿肌率和腹脂率的遗传效应达到显著水平(P＜0.05);在91d鸡群中,TT型个体的胸肌率显著高于CT型个体(P＜0.05);在所有鸡群中,TT型个体的腹脂重,胸肌率,腿肌率和腹脂率显著高于CT和CC型个体(P＜0.05)。SNP4位点(T5107545C):在70d鸡群中,TT型个体的胸肌重,腿肌重和腿肌率显著高于CC型个体(P＜0.05),而TC型个体的皮脂厚显著高于CC型个体(P＜0.05);在91d鸡群中,TT型个体的屠体重,活重,半净膛重和全净膛重显著高于CC型个体(P＜0.05);在所有鸡群中,TC型个体的活重,活重和全净膛重显著高于TT型个体,而TT型个体的腿肌率显著高于CC型个体(P＜0.05)。SNP5位点(C5107640T):在70d鸡群中,不同基因型只与胸肌率显著相关(P＜0.05);在所有鸡群中,SNP5对应的不同基因型间的皮脂厚性状差异显著(P＜0.05)。SNP6位点(A5106005G):在70d鸡群中,AG型个体的胸肌重和胸肌率显著高于AA和GG型个体(P＜0.05);在91d和所有鸡群中,GG型个体的活重,屠体重,半净膛重,全净膛重和腿肌重显著高于AA型个体(P＜0.05)。SNP7位点(G5105481A):在70d和90d鸡群中,GG型个体的活重和全净膛重显著高于AG型个体(P＜0.05);在所有鸡群中,AG型个体的胸肌率显著高于AA型个体(P＜0.05)。SNP8位点(C5105454T):在3个鸡群中不同基因型个体的所有屠宰性状之间差异不显著(P＞0.05)。单倍型与8个群体的屠宰性状关联分析结果显示:在70d鸡群中,单倍型组合对活重,屠体重,全净膛重,胸肌重,腿肌重,腹脂率,胸肌率和腿肌率的遗传效应达到显著水平(P＜0.05);在91d鸡群中,单倍型组合对活重,屠体重,全净膛重,半净膛重,腹脂重,皮脂厚,胸肌率,腿肌率和腹脂率的遗传效应达到显著水平(P＜0.05);在所有鸡群中,单倍型组合对活重,屠体重,全净膛重,半净膛重,腹脂重,腿肌重,皮脂厚,胸肌率,腿肌率和腹脂率的遗传效应达到显著水平(P＜0.05)。