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第一部分:甲状腺乳头状癌与合并桥本氏甲状腺炎的甲状腺乳头状癌临床特点分析目的:探讨单纯甲状腺乳头状癌（PTC）和合并桥本氏甲状腺炎（HT）的PTC的发病特点和区别。方法:回顾性分析天津医科大学总医院普通外科在2010年1月至2014年12月5年间手术治疗的5653例甲状腺患者,统计分析单纯PTC手术患者占所有手术患者的比例,合并HT的PTC手术患者占所有手术的HT患者比例,以及两组患者的临床特点。结果:（1）5653例手术治疗的患者中,HT患者441例（含合并PTC患者133例）,单纯PTC1332例,合并HT的手术患者与其余未合并HT的甲状腺手术患者相比,罹患乳头状癌的比例增加,有统计学差异（P=0.02）;（2）合并HT的PTC手术组患者与单纯PTC手术组患者相比,年龄无差异;（3）合并HT的PTC手术组患者与单纯PTC手术组患者相比,性别比有差异（P=0.002）;（4）合并HT的PTC手术组患者与单纯PTC手术组患者相比,微小癌的比例有差异（P=0.019）;（5）合并HT的PTC手术组患者与单纯PTC手术组患者相比,AJCC分期有差异（P=0.013）。结论:经手术治疗的HT患者中发生PTC的可能性要高于未发生HT的甲状腺手术患者人群。合并HT的PTC患者与单纯PTC的患者在年龄上无统计学差异。HT的女性患者发生PTC的可能性更高。合并HT的PTC患者的肿瘤分期相较于单纯PTC患者较好。第二部分:甲状腺乳头状癌和合并桥本氏甲状腺炎的甲状腺乳头状癌中BRAFV600E和RET/PTC基因突变的检测及分析目的:研究在甲状腺乳头状癌（PTC）和合并HT的甲状腺乳头状癌中BRAFV600E突变、RET/PTC重排的临床意义。方法:应用聚合酶链式反应（PCR）技术、巢式PCR技术和基因直接测序法检测93例HT合并PTC癌组织和90例单纯PTC癌组织BRAF基因点突变和RET/PTC重排的情况。分析在两组中BRAFV600E突变和RET/PTC重排的临床及病理特征。结果:（1）按照AJCC分期,93例PTC合并HT中,I期、II期、III期和IV期各有65例、13例、11例和4例;90例单纯PTC中,I期、II期、III期和IV期各有43例、10例、24例和13例,两组在肿瘤分期上存在显著性差异,P=0.02。（2）PTC合并HT癌组织中BRAFV600E突变者22例,单纯PTC癌组织中BRAFV600E突变者34例,比例分别为23.7%（22/93）,37.8%（34/90）,有显著性差异,P=0.038。（3）93例PTC合并HT中,I期、II期、III期和IV期各有65例、13例、11例和4例,BRAFV600E突变者22例中,I期、II期、III期和IV期各有12例、4例、4例和2例,BRAF突变型和野生型在肿瘤分期上无显著性差异,P=0.244。（4）90例单纯PTC中,I期、II期、III期和IV期各有43例、10例、24例和13例,BRAFV600E突变者34例中,I期、II期、III期和IV期各有9例、4例、13例和8例,BRAF突变型和野生型在肿瘤分期上有显著性差异,P=0.011。（5）PTC合并HT组癌组织中RET/PTC重排有29例,单纯PTC组癌组织中RET/PTC重排有16例,比例分别为31.2%（29/93）和17.8%（16/90）,有显著性差异P=0.035。（6）PTC合并HT组RET/PTC重排29例中,I期、II期、III期和IV期各有22例、3例、3例和1例,RET/PTC突变型和野生型在肿瘤分期上无显著性差异,P=0.858。（7）单纯PTC组RET/PTC重排16例中,I期、II期、III期和IV期各有9例、4例、2例和1例,RET/PTC突变型和野生型在肿瘤分期上无显著性差异,P=0.764。结论:（1）PTC合并HT相较于单纯PTC肿瘤分期较早。（2）BRAFV600E基因突变在单纯PTC中比在合并HT的PTC中更为常见。（3）BRAFV600E基因突变与93例合并HT的PTC的肿瘤分期无显著相关。（4）BRAFV600E基因突变与90例单纯PTC的肿瘤分期相关。（5）RET/PTC基因重排在PTC合并HT比单纯PTC中更为常见。（6）RET/PTC基因重排与93例合并HT的PTC的肿瘤分期无显著相关。（7）RET/PTC基因重排与90例单纯PTC的肿瘤分期无显著相关。第三部分:HLA分型与甲状腺疾病以及BRAF基因突变关系的研究目的:研究HLA亚型分布与PTC、HT、合并HT的PTC以及结节性甲状腺患者之间的关系,探讨BRAFV600E突变在免疫抗原识别及呈递中的作用。方法:应用PCR-SSP法对164例甲状腺手术患者进行HLA亚型检测,统计其HLA亚型分布频率情况,并与中华骨髓库提供的正常人群HLA亚型分布进行比较。利用生物信息学软件SYFPEITHI对BRAFV600E突变在免疫识别中的作用进行评分。结果:（1）HLA-A亚型在正常人群和PTC患者中的分布频率存在统计学差异。（2）HLA-A亚型在正常人群与合并HT的PTC患者中的分布频率存在统计学差异。（3）不同的甲状腺疾病之间,HLA-A亚型分布频率也存在差异（4）HLA-DR亚型在正常人群和PTC患者中的分布频率无统计学差异。（5）BRAF基因野生型和突变型与HLA-A2、HLA-A24亚型结合识别评分存在差异。结论:（1）HLA亚型的分布频率与PTC以及合并HT的PTC的发生存在一定的相关性。（2）BRAF基因野生型和突变型与HLA-A2和HLA-A24亚型结合力的不同,可能是影响PTC发生的一个因素。