当前,创新已上升到国家战略,“十三五规划”、工业4.0的推出都对企业的研发活动进行着政策指引。而要实现创新,进行研发投入是唯一途径。近年来,我国的R&D经费投入不断增加,但是创新产出成果仍然不能令人满意。因此,研发投入强度对于企业创新绩效究竟能否起到正向作用,是一个需要进行检验的问题。同时,所处在的行业市场是企业实现利润的平台,其对企业的生产运营、管理决策以及未来发展作用巨大。那么,产品市场竞争能否促进企业加大研发、提高创新能力也值得加以探讨。本文使用文献综述、描述性统计和实证分析相结合的研究方法。第一,运用内生增长理论和R&D两面性理论阐述研发投入对企业创新绩效的作用;通过“熊彼特效应”、“逃离竞争效应”等经济学理论解释产品市场竞争对于企业创新可能造成的影响,并运用创造性毁灭理论、委托代理理论对市场竞争的调节作用进行了解释;还从资源和压力两个方面,解释了产品市场竞争对不同所权性质企业调节作用的差异。第二,对我国医药制造业研发投入情况、创新产出情况和产品市场竞争情况进行描述性统计分析,并进行国内外以及时间发展上的对比分析。第三,通过实证分析的方式研究研发投入强度对企业创新绩效的影响,以及产品市场竞争的调节作用:首先,探究研发投入强度对企业创新绩效的作用以及作用方向;其次,研究产品市场竞争对二者关系的影响,并区分企业所有权性质以期获得更为具体的结论。最后,依据研究结果形成研究结论,并为优化医药制造业创新绩效提出合理建议。本文的研究结论主要包括以下三个点:①企业研发投入强度能够显著提升企业创新绩效;②产品市场竞争在研发与创新的关系中起到调节作用,能够加强研发投入强度对创新绩效的正向作用;③相较于国有企业,对民营企业而言,产品市场竞争对上述二者的加强作用更为显著,其对于市场竞争的敏感程度更高。依据以上研究结论,本文从企业和政府两个层面出发,基于研究结论有针对性地提出如下建议:①企业应提升自主创新意识,加大研发投入,提高资金使用效率;②政府应创造良性竞争的市场环境,完善知识产权保护的法律环境;③政府应健全补贴激励机制,营造良好的金融政策支持环境;④应充分发挥市场作用,促使不同所有制企业公平竞争;⑤政府应向中小规模企业提供帮助。